Kit di test diagnostico cobas®

per diagnosi COVID-19per malattie respiratorieper malattie respiratorie

Panoramica
cobas® Respiratory flex è un test automatizzato, multiplex e qualitativo per acidi nucleici da utilizzare sui sistemi cobas® 5800/6800/8800. Utilizza PCR in tempo reale e la tecnologia TAGS (Temperature Activated Generation of Signal) di Roche per consentire il rilevamento e la differenziazione simultanei di più bersagli virali respiratori in un unico pozzetto. Il saggio fornisce fino a 12 risultati virali più un controllo interno ARN per pozzetto ed è destinato all'uso diagnostico in vitro (IVD) su campioni di tampone nasofaringeo prelevati da soggetti con segni e sintomi di infezione delle vie respiratorie, in combinazione con fattori clinici ed epidemiologici.

Uso previsto / Applicazione clinica
Rilevamento qualitativo e differenziazione degli acidi nucleici virali respiratori per supportare la diagnosi di infezione respiratoria quando utilizzato insieme a informazioni cliniche ed epidemiologiche. I risultati negativi non escludono l'infezione; i risultati positivi non escludono la coinfezione e possono non indicare la causa definitiva della malattia. A causa della somiglianza genetica tra rhinovirus umano ed enterovirus, il saggio non è in grado di distinguerli in modo affidabile.

Caratteristiche principali e processo

• Preparazione del campione completamente automatizzata (estrazione e purificazione degli acidi nucleici) seguita da amplificazione PCR e rilevamento sui sistemi cobas® 5800/6800/8800.
• Estrazione simultanea dell'acido nucleico e del controllo interno ARN (RNA IC); l'acido nucleico viene rilasciato mediante proteinasi e reagente di lisi, legato a particelle di vetro magnetico, lavato ed eluito.
• La tecnologia TAGS consente la differenziazione di più bersagli per canale di fluorescenza combinando 5 canali di fluorescenza con 3 canali di rilevamento termico (T1, T2, T3), permettendo la rilevazione/differenziazione fino a 15 bersagli per pozzetto in implementazioni future e fino a 12 risultati virali respiratori più il RNA IC con questo kit.
• Il master mix contiene una DNA polimerasi termostabile, sonde TAGS e dUTP più AmpErase (uracil-N-glicosilasi) per il controllo della contaminazione da carryover.

Pannello bersagli (bersaglio — gene target)
Bersaglio — Gene target
Influenza A — Matrix protein 1 (M1)
Influenza B — Non-structural protein NS-1/2 (NS1/NEP)
Respiratory Syncytial Virus (RSV) — Matrix protein (M)
SARS-CoV-2 — ORF1ab polyprotein and ORF1a polyprotein (ORF1ab / ORF1a)
Adenovirus (specie B, E) — Terminal protein precursor (E2B)
Adenovirus (specie C) — Capsid protein precursor (L3)
Human Metapneumovirus — Matrix protein (M)
Enterovirus / Rhinovirus — 5' untranslated region (5'UTR)
Coronavirus OC43 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus HKU1 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus 229E — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Coronavirus NL63 — Replicase polyprotein 1a/1b (ORF1ab)
Human Parainfluenza Virus 1 — L polymerase protein (L)
Human Parainfluenza Virus 2 — Large protein (L)
Human Parainfluenza Virus 3 — Nucleocapsid protein (N)
Human Parainfluenza Virus 4 — Large protein (L)

Note analitiche / operative

• Utilizza primer target-specific forward/reverse e sonde marcate fluorescenti; il segnale delle sonde TAGS richiede il taglio da parte di una nucleasi seguito da un aumento della temperatura di reazione per attivare la fluorescenza.
• La fluorescenza viene acquisita su più canali e a tre temperature definite per ciclo per consentire la differenziazione multiplex.
• I controlli esterni positivi e negativi vengono processati allo stesso modo dei campioni clinici.

Limitazioni

• I risultati negativi non escludono un'infezione respiratoria e non devono essere usati come unico criterio per la gestione del paziente.
• I risultati positivi non escludono le coinfezioni e l'agente rilevato potrebbe non essere la causa definitiva della malattia.
• Non è in grado di distinguere in modo affidabile il rhinovirus umano dall'entero virus a causa della somiglianza genetica.

Vantaggi / punti salienti

• Flessibilità nella selezione dei bersagli e possibilità di ottenere risultati aggiuntivi (riflesso digitale) dallo stesso kit/corsa.
• Consente la consolidazione di più bersagli respiratori in una soluzione personalizzabile sui sistemi esistenti della famiglia cobas® x800 senza aggiornamenti hardware o software.
• Progettato per semplificare la logistica di laboratorio, ridurre i test duplicati e supportare una diagnosi PCR efficiente con tempi di risposta rapidi.

Caratteristiche / specifiche tecniche

• Bersagli: Influenza A, Influenza B, RSV, SARS-CoV-2, adenovirus (B, C, E), metapneumovirus umano, enterovirus/rhinovirus, coronavirus umani comuni (229E, HKU1, NL63, OC43), parainfluenza 1–4.
• Tipo di campione: tamponi nasofaringei raccolti in Copan UTM-RT® o BD™ Universal Viral Transport (UVT) o equivalente.
• Volume minimo di campione: 0,4 mL.
• Tecnologia: PCR in tempo reale con multiplex TAGS di Roche (Temperature Activated Generation of Signal).
• Dimensione del kit: 192 test per kit.
• Stabilità del kit aperto: 90 giorni con 40 riutilizzi.
• Controllo interno: Controllo interno ARN incluso e co-estratto.