Kit di test del cancro del polmone AVENIO ctDNA V2

da ricercaper cancro colorettaleper cfDNA

Stato normativo
Solo per uso di ricerca. Non per uso diagnostico.

Panoramica
Il AVENIO ctDNA Surveillance Kit V2 è un test di ricerca per biopsia liquida basato su sequenziamento di nuova generazione (NGS), progettato e ottimizzato per il monitoraggio longitudinale della burden tumorale nella ricerca su carcinoma polmonare e carcinoma colorettale. Il pannello Surveillance consente l'identificazione, il profiling e il monitoraggio delle alterazioni genomiche su un ampio set di geni e regioni correlate al cancro. Il kit include reagenti, software di analisi e componenti bioinformatici necessari per rilevare aberrazioni genomiche nei tumori solidi; è richiesto un Oncology Analysis Server per eseguire la pipeline bioinformatica.

Applicazioni previste

• Monitoraggio longitudinale della burden tumorale (carcinoma polmonare, carcinoma colorettale)
• Profiling tumorale non invasivo e monitoraggio seriale
• Rilevamento di un'ampia gamma di classi di mutazione (SNV, indels, fusioni, CNV)

Flusso di lavoro (panoramica)

• Isolare cfDNA dal plasma (AVENIO cfDNA Isolation Kit V2)
• Preparare le librerie per il sequenziamento (AVENIO ctDNA Library Prep Kit V2)
• Eseguire l'arricchimento target (AVENIO ctDNA Enrichment Kit V2)
• Utilizzare uno dei pannelli AVENIO ctDNA (Targeted, Expanded, Surveillance) e l'AVENIO Post-Hybridization Kit V2
• Sequenziamento del DNA

Vantaggi principali

• Prestazioni analitiche: Le prestazioni analitiche sono supportate da strategie integrate di soppressione degli errori digitali (iDES) che combinano barcode molecolari con tecniche di soppressione degli errori in silico per migliorare il rilevamento di varianti a bassa frequenza.
• Flusso di lavoro semplificato: Workflow di ricerca end-to-end ottimizzato in circa cinque giorni dall'estrazione all'analisi e al reporting.
• Ricerca completa: Permette di testare un ampio set di geni e classi di mutazioni in un unico test — copertura estesa per supportare il monitoraggio della burden tumorale, il profiling e la rilevazione di biomarcatori di resistenza.

Caratteristiche chiave del prodotto

• Geni delle linee guida NCCN: il test include geni citati nelle linee guida della U.S. National Comprehensive Cancer Network (NCCN).
• Tutte le classi di mutazione: un unico test rileva SNV, indels, fusioni e CNV.
• Pacchetto completo: reagenti, pipeline bioinformatica e software forniti come parte della soluzione AVENIO ctDNA Analysis Kits V2.

Prestazioni analitiche (sintesi)
Classe di mutazione | Limite riportato / note sulla sensibilità
SNV: sensibilità riportata allo 0,5% AF (per 50 ng di DNA in ingresso) — Sensibilità >99%, PPV >95%
Indels: sensibilità riportata all'1,0% AF (per 50 ng di DNA in ingresso) — Sensibilità >99%, PPV >99%
Fusioni: sensibilità riportata all'1,0% — Sensibilità >99%, PPV >99%
CNV: dipende dal campione; il kit riporta CNV di ERBB2, EGFR e MET; le prestazioni dipendono dal tipo di campione, dalla quantità di DNA in ingresso, dal contenuto tumorale e dal numero di copie genomiche (specificità CNV riportata PPV >99% nello studio tecnico).

Note su sensibilità e input
Le metriche di sensibilità e PPV riportate si riferiscono alle prestazioni con 50 ng di DNA in ingresso alle frequenze alleliche indicate. Il kit può riportare varianti fino allo 0,1% AF (con sensibilità ridotta) e può preparare librerie con un minimo di 10 ng in ingresso. Le prestazioni indicate richiedono una profondità di sequenziamento sufficiente (es. ~40 milioni di letture per campione per i pannelli AVENIO ctDNA V2) e il sequenziamento su strumenti Illumina compatibili in modalità Research Use Only.

Download e documentazione (disponibili)
Elenco dei geni, brochure del software e brochure del prodotto sono forniti come documenti tecnici associati al prodotto (PDF elencati nei download).