Migliora la precisione e la produttività con gli adattatori e gli accessori KAPA
Nel sequenziamento di nuova generazione (NGS), l’uso di adattatori indicizzati per l’assegnazione di codici a barre ai campioni aumenta notevolmente l’efficienza. Questo processo, noto come multiplexing, consente di raggruppare numerosi campioni in un’unica sessione di sequenziamento; le letture risultanti vengono poi ordinate tramite analisi bioinformatica.
Tuttavia, alcuni sequenziatori ad alta produttività sono soggetti a errori di assegnazione degli indici (index hopping), che possono ridurre la qualità dei dati. Le strategie di doppia indicizzazione univoca (UDI) aiutano a mitigare l’impatto di questi eventi.
Roche offre due tipi di adattatori KAPA:
Adattatori a lunghezza intera: per la preparazione dei campioni senza PCR con un massimo di 96 combinazioni di indici
Adattatori KAPA UDI
I vantaggi in sintesi
I bassi tassi di errata assegnazione aumentano l’affidabilità dei risultati
L’errata assegnazione degli indici durante il sequenziamento multiplex può derivare da diversi fattori, tra cui:
Salto di indice
Contaminazione incrociata di codici a barre o campioni
Cambio di template durante l’amplificazione PCR di campioni raggruppati
Errori di sequenziamento o di analisi
Alcuni di questi problemi possono essere mitigati attraverso un’attenta progettazione degli adattatori e un rigoroso controllo di qualità.
Gli adattatori UDI KAPA sono progettati per garantire risultati affidabili grazie a:
Combinazioni uniche a doppio indice che consentono di filtrare le letture con combinazioni di codici a barre inattese prima dell’analisi dei dati
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