Mezzo reattivo KAPA HyperCap

soluzione tamponea biglie magneticheper oncologia

Panoramica I pannelli fissi (catalogo) KAPA HyperCap e i kit correlati offrono soluzioni pronte all'uso per l'arricchimento target basato su ibridazione nei flussi di lavoro di ricerca (Solo per uso di ricerca, RUO). Combinano esperienza nel design delle sonde e controllo di produzione per garantire qualità di lotto coerente e alta efficienza di sequenziamento in applicazioni di oncologia e malattie ereditarie.

Pannello KAPA HyperCap Oncologia Il pannello Oncologia è una destinazione di cattura di ~214 Kb che copre le sequenze codificanti complete di 13 geni somatici (ATM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, CHEK2, EGFR, ERBB2, KRAS, MET, MYCN, RAD51C, RAD51D, TP53) più varianti hotspot in ~69 geni aggiuntivi. È ottimizzato per tipi di campioni impegnativi (FFPET/FFPE e cfDNA) con tuning per elevata uniformità e specificità. Esempi di prestazioni riportate includono >94% di posizioni senza errore da DNA FFPET di bassa quantità/qualità e solide metriche di copertura profonda (uniformità: >92% delle basi entro 0,5x–2x della mediana; >88% delle basi esoniche coperte >300x).

Pannello KAPA HyperCap Heredity Il pannello Heredity è una destinazione di cattura di circa 10 Mb che copre 3.332 geni associati alla ricerca sulle malattie ereditarie e include varianti ClinVar patogene/probabilmente patogene. È progettato per efficienza di sequenziamento con uniformità ottimizzata e bassi tassi di duplicazione, fornendo alta percentuale di copertura del target (es.: 98,5% delle basi target coperte a 30x; copertura media ~92,6x). Il controllo qualità delle sonde per lotto aiuta a garantire prestazioni coerenti.

Vantaggi in sintesi

• Alta qualità ed efficienza di sequenziamento per FFPET e cfDNA grazie al design e alla produzione ottimizzati delle sonde.
• Workflows KAPA HyperCap compatibili con automazione: KAPA HyperPrep, KAPA HyperPlus e KAPA Universal UMI Adapters; supporta multiplexing pre-capture per aumentare il throughput.
• Contenuto mirato: pannello oncologia per i principali geni somatici e hotspot; pannello heredity per migliaia di geni associati a malattie ereditarie e contenuto ClinVar per la ricerca germinale.
• Disponibilità pronta a magazzino come pannelli e kit di catalogo con QC NGS delle sonde per lotto.

Esempi selezionati di articoli di catalogo (numero materiale — descrizione — EAN) KAPA HyperCapture Reagent Kit, 24 rxn — 07613336198186
KAPA HyperCapture Reagent Kit, 96 rxn — 07613336198179
KAPA HyperCapture Reagent V2 Kit, 24 rxn — 07613336242315
KAPA HyperCapture Reagent V2 Kit, 96 rxn — 07613336242322
KAPA HyperCap Heredity panel, 24 rxn — 07613336188408
KAPA HyperCap Heredity panel, 48 rxn — 07613336188415
KAPA HyperCap Heredity panel, 96 rxn — 07613336188422
KAPA HyperCap Heredity panel, 192 rxn — 07613336188439
KAPA HyperCap Oncology panel, 12 rxn — 07613336188361
KAPA HyperCap Oncology panel, 24 rxn — 07613336188378
KAPA HyperCap Oncology panel, 48 rxn — 07613336188385
KAPA HyperCapture Bead Kit, 24 rxn — 07613336198209
KAPA HyperCapture Bead Kit, 96 rxn — 07613336198193
KAPA Universal Enhancing Oligos, 24 rxn — 07613336198162
KAPA Universal Enhancing Oligos, 96 rxn — 07613336198155

Note su performance e workflow I riassunti di convalida includono valutazioni di performance per workflow con DNA FFPET (KAPA HyperCap FFPET DNA Workflow), workflow cfDNA (KAPA HyperCap cfDNA Workflow) e approcci sia a singolo campione sia multiplexati. Esempi di input nelle validazioni: 10 ng DNA FFPE, 10 ng cfDNA, 100 ng gDNA per multiplexing pre-capture. Le metriche riportate includono percentuale on-target, fold-80 base penalty, tassi di duplicazione PCR, percentuale di basi a profondità specificate (es. >=30x) e conteggi mediani di letture dopo deduplicazione UMI.

Specifiche tecniche

• Uso regolatorio: Solo per uso di ricerca (RUO). Non per uso diagnostico.
• Famiglia di prodotto: Pannelli catalogo KAPA HyperCap e kit correlati (reagenti, kit di bead, tamponi di risospensione, oligo migliorativi, ecc.).
• Dimensioni target: Oncologia ~214 Kb (13 geni CDS completi + contenuto hotspot); Heredity ~10 Mb (3.332 geni + contenuto ClinVar).
• Compatibilità campioni: FFPET/FFPE, DNA circolante libero (cfDNA), DNA genomico (gDNA).
• Input convalidati tipici: 10 ng DNA FFPE; 10 ng cfDNA; 100 ng gDNA per workflow multiplexati pre-capture.
• Metrica chiave: Es. Oncologia — >94% posizioni senza errore; >92% basi entro 0,5x–2x della mediana; >88% basi esoniche >300x. Es. Heredity — 80,9% letture on-target; fold-80 1,42; duplicazione PCR 2,2%; 98,5% basi target a 30x; copertura media ~92,6x.
• Compatibilità workflow: Workflows KAPA HyperCap inclusi KAPA HyperPrep, KAPA HyperPlus, KAPA EvoPrep Boost / EvoPlus Boost; supporta adattatori UMI e strategie single-library o multiplexate pre-capture.
• Controllo qualità: QC sondes NGS effettuato su ogni lotto per garantire coerenza.
• Disponibilità: Pannelli e kit catalogo pronti a magazzino; diversi formati/confezioni e numeri di reazione (es.: 12, 24, 48, 96, 192, 384 reazioni a seconda dell'articolo).