Reagente NGS KAPA

in soluzionemezzo reattivodi ibridazione

Panoramica
Arricchimento target NGS efficiente con i workflow Roche KAPA HyperCap e KAPA HyperPETE. Soluzioni per pannelli ampi e mirati, con supporto per design personalizzati e campioni a basso input come il cfDNA.

Soluzione
Portafoglio completo di arricchimento target basato su due tecnologie complementari. Il workflow KAPA HyperCap è basato su cattura ibrida, adatto a pannelli più grandi e alla rilevazione estesa di varianti. Il workflow KAPA HyperPETE utilizza l’arricchimento tramite estensione primer (PETE), progettato per pannelli piccoli e input ultra‑bassi (es. cfDNA). KAPA HyperPETE offre la velocità e semplicità tipiche degli amplicon insieme alle prestazioni della cattura ibrida, inclusa uniformità e tassi on‑target elevati.

Offerte integrate
Workflow integrati con sonde/primer di alta qualità e KAPA Library Prep Kits, che supportano l’intero flusso campione→libreria per progetti di sequenziamento target.

• Sonde Exome: soluzioni whole‑exome ottimizzate per ampia copertura dei database
• Catalog panels: pannelli genici fissi disponibili a magazzino per rapido impiego
• Design Share panels: pannelli progettati da esperti in collaborazione con ricercatori
• Sonde personalizzate: design su misura per qualsiasi regione genomica umana o non‑umana

Tipi di prodotto e punti salienti
Esempi rappresentativi del portafoglio e brevi descrizioni:

• KAPA HyperExome V2 Probes and Kits: soluzione di whole exome sequencing pensata per ampia copertura
• AVENIO Edge System: manipolatore liquido IVD completamente automatizzato per preparazione librerie, arricchimento target, quantificazione, normalizzazione e pooling
• KAPA EvoPlus Boost Kits: preparazione librerie DNA con frammentazione enzimatica e flusso ottimizzato per automazione
• KAPA HyperCap Catalog Panels and Kits: pannelli genici per workflow di ricerca in arricchimento target
• KAPA HyperPETE Catalog Panels and Kits: pannelli fissi basati sulla tecnologia KAPA HyperPETE
• Design Share Panels: design NGS sviluppati da scienziati Roche e collaboratori
• HyperDesign: strumento di design personalizzato che combina la tecnologia KAPA con l’esperienza Roche in sonde/primer
• KAPA HyperCap Custom Probes / KAPA HyperPETE Custom Probes: sonde/pannelli personalizzati per regioni DNA e RNA

Valore
L’arricchimento target concentra le letture di sequenziamento su regioni selezionate, riducendo costi e carico computazionale rispetto al sequenziamento dell’intero genoma. Ciò consente maggiore profondità sui target, migliorando la sensibilità per varianti somatiche a bassa frequenza in campioni eterogenei o a basso input — cruciale per ricerca oncologica e traslazionale.

Vision
Roche fornisce soluzioni di arricchimento target NGS di catalogo, pre‑progettate e completamente personalizzabili per affrontare le sfide del sequenziamento e fornire risultati sensibili e precisi da target difficili o a basso input.

Confronto / Considerazioni (sintesi)
Una tabella comparativa dettagliata sul sito confronta KAPA HyperCap, KAPA HyperPETE e i workflow basati su amplicon rispetto a facilità d’uso, prestazioni, tecnologia, tempi, dimensione del pannello, applicazioni e supporto all’analisi. I principali riscontri tecnici sono riepilogati di seguito.

Note
I prodotti e i kit sono destinati all’uso per ricerca (RUO) quando indicato.

Specifiche tecniche

• Workflows: KAPA HyperCap Workflow (cattura per ibridazione); KAPA HyperPETE Workflow (Primer Extension Target Enrichment); Workflows basati su amplicon (amplificazione PCR)
• Facilità d’uso: KAPA HyperCap – adatto all’automazione con tempo operatore ridotto; KAPA HyperPETE – workflow in una giornata e automatizzabile; Amplicon – workflow più rapido
• Prestazioni: KAPA HyperCap – alta efficienza di sequenziamento e rilevamento di tutte le classi di mutazione; KAPA HyperPETE – massima efficienza in piccoli pannelli e rilevamento di tutte le classi di mutazione; Amplicon – buona performance SNV/Indel, uniformità inferiore e rilevamento CNV/fusioni nuove limitato
• Tempi: KAPA HyperCap – ~1,5 giorni; KAPA HyperPETE – una giornata; Amplicon – un turno
• Dimensione del pannello: KAPA HyperCap – fino a whole exome e oltre; KAPA HyperPETE – fino a ~250 Kb; Amplicon – fino a pochi megabase (limiti pratici)
• Applicazioni: KAPA HyperCap – genetica ereditaria e ricerca oncologica ereditaria/somatica; KAPA HyperPETE – ricerca oncologica somatica e rilevamento di fusioni RNA (partner noti e nuovi); Amplicon – ricerca oncologica somatica e genetica ereditaria (fusioni note)
• Supporto analisi secondaria: KAPA HyperCap & KAPA HyperPETE – supporto per analisi secondaria germinale e somatica con strumenti bioinformatici open‑source; Amplicon – dipende dal fornitore