Software da ricerca AVENIO Designer
per sequenziamento NGSper genomicaper sequenziamento

Software da ricerca - AVENIO Designer - Roche Sequencing Solutions - per sequenziamento NGS / per genomica / per sequenziamento
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Caratteristiche

Applicazioni
da ricerca, per sequenziamento NGS, per genomica, per sequenziamento
Funzione
per sequenziamento di nuova generazione, di progettazione

Descrizione

Panoramica
Software basato su template per il rapido e flessibile deployment di workflow definiti dall'utente sulla piattaforma AVENIO Edge. Interfaccia con parametri regolabili che permette di modificare i workflow durante l'esecuzione; i template convalidati sono precompilati con parametri raccomandati e possono essere adattati secondo necessità.

Applicazioni
I kit di reagenti AVENIO Edge User-Defined Workflow (UDW) sono adatti alla preparazione di librerie NGS e all'arricchimento target in basso e alto throughput, comprendendo frammentazione del DNA, riparazione delle estremità, A-tailing, ligazione degli adattatori, amplificazione delle librerie e ibridazione con un pannello di cattura definito dall'utente, seguite da amplificazione e pooling. È possibile attivare o disattivare passaggi selezionati e ogni passaggio dispone di parametri personalizzabili (tempo, temperatura, cicli PCR, rapporti di lavaggio con perle, ecc.). Supporta opzioni di pooling pre-capture e post-capture.
  • Costruzione delle librerie compatibile con vari tipi di campione e input (50 ng a 1 μg)
  • Tipi di campione compatibili: DNA genomico; DNA da sangue intero; DNA estratto con Roche MagNA Pure 96 o MagNA Pure 24
  • Le librerie finali possono essere poolate a 4 nM
  • Compatibilità con sequencer: Illumina NextSeq, MiSeq, NovaSeq

Avvertenza normativa
Solo per uso di ricerca. Non per procedure diagnostiche.

Caratteristiche tecniche
  • Nome del prodotto: AVENIO Designer
  • Denominazione commerciale (modello): AVENIO Designer
  • ID prodotto: INS_6992
  • Tipo di prodotto: Software (software di strumento o di sistema)
  • Famiglia di prodotti: AVENIO (AVENIO Edge)
  • Versione software: AVENIO Designer Software - 2.x
  • Uso previsto: Solo per uso di ricerca (RUO)
  • Tecnica supportata: Next-generation sequencing (NGS)
  • Capacità workflow: Workflow definiti dall'utente (UDW) con parametri personalizzabili; passaggi attivabili/disattivabili; i workflow possono fermarsi/avviarsi in qualsiasi passaggio; supporta pooling pre-capture e post-capture
  • Passaggi supportati per la preparazione delle librerie: frammentazione del DNA, riparazione delle estremità, A-tailing, ligazione degli adattatori, amplificazione della libreria, ibridazione delle sonde, amplificazione, pooling
  • Intervallo di input per i kit di reagenti AVENIO Edge UDW: 50 ng a 1 μg
  • Sistemi di estrazione compatibili: Roche MagNA Pure 96, MagNA Pure 24
  • Sequencer compatibili: Illumina NextSeq, MiSeq, NovaSeq
  • Servizi elettronici: Non disponibile
  • Numeri di materiale / riferimenti: 09 351 604 001; 9 351 604 001; 09351604001; 9351604001

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