Adattatore per la biofarmacia KAPA Adapters

per R&S

Panoramica
Gli adattatori KAPA sono adattatori di ligazione full‑length e troncati per la costruzione di librerie NGS di DNA e RNA, compatibili con le piattaforme di sequenziamento Illumina. Offrono multiplexing flessibile e riducono gli errori di assegnazione degli indici tramite schemi a indici doppi unici (UDI) e UMIs opzionali, con configurazioni fino a 384‑plex.

Tipi di adattatori

• Adattatori full‑length: KAPA UDI Adapters — destinati a preparazioni senza PCR; forniscono combinazioni UDI uniche non ridondanti, forniti a 15 µM.
• Adattatori troncati: KAPA Universal Adapter e KAPA Universal UMI Adapter — permettono maggiore capacità di indici e opzione UMI; forniti a 15 µM (Universal) e 33 µM (Universal UMI).
• Mix di primer KAPA UDI: piastre di primer preformattate che coprono set di indici 1–384 per l'uso con adattatori Universal; convalidati per flussi UMI e non‑UMI.

Vantaggi principali

• Mitigazione della errata assegnazione degli indici: l'indicizzazione doppia unica permette di filtrare coppie di barcode inattese prima dell'analisi, riducendo artefatti da index hopping.
• QC basato sul sequenziamento e controllo di produzione per minimizzare la contaminazione incrociata dei barcode.
• Conversione coerente tra metodi di frammentazione (Covaris e frammentazione enzimatica) per prestazioni di libreria affidabili.
• Compatibilità con workflow WGS umano senza PCR quando usato con i kit KAPA EvoPrep e KAPA EvoPlus V2.
• Multiplexing flessibile da basso a elevato livello (fino a 384‑plex) a seconda della configurazione adattatore / mix di primer.

Uso raccomandato

• Costruzione di librerie NGS mediante ligazione per DNA e RNA.
• Preparazioni di librerie senza PCR con KAPA UDI Adapters e kit KAPA convalidati.
• Progetti di sequenziamento ad alto rendimento che richiedono mitigazione dell'index hopping e demultiplexing affidabile dei campioni.

Panoramica comparativa degli adattatori KAPA (sintesi)
Numero di UDI: 96 (KAPA UDI Adapters) / 384 (KAPA Universal Adapter / KAPA Universal UMI Adapter)
Numero di barcode P5 + P7 non ridondanti a 8 nt: 96+96 / 384+384 / 384+384
Barcode identici agli adattatori forniti da Illumina: No / No / No
Raccomandato per strumenti Illumina (flow cell patterned o non‑patterned): Sì / Sì / Sì
Preparazione senza PCR (marcata molecolarmente): No / No / No
Validato per KAPA EvoPrep Kit, KAPA EvoPlus V2 Kit: Validato / Compatibile / Compatibile
Validato per KAPA RNA EvoPrep Kit: Validato / Validato / Compatibile
Compatibile con KAPA Universal Enhancing Oligos: Sì / Sì / Sì
Formulazione adattatore: Full‑length pronto all'uso 15 µM (4 reazioni/adattatore) / Troncato pronto all'uso 15 µM (1 reazione/adattatore) / Troncato pronto all'uso 33 µM (1 reazione/adattatore)
Configurazione kit: piastra rigida 96‑pozzetti con etichettatura adatta all'automazione, sovrariempimenti e sigilli di ricambio (KAPA UDI Adapters) / tubi adattatori e piastre di mix primer 96‑pozzetti con etichettatura adatta all'automazione e sovrariempimenti (varianti Universal/UMI)
Buffer di diluizione adattatore KAPA incluso: Sì (25 mL per kit KAPA UDI) / Non incluso per adattatori troncati

Prestazioni e note QC

• Test QC interni basati sul sequenziamento valutano la contaminazione incrociata dei barcode legando ogni UDI a un inserto sintetico unico, pooling e sequenziando le librerie e valutando la distribuzione di letture per coppia barcode/inserto.
• Gli UDI non ridondanti riducono sostanzialmente la contaminazione apparente attribuibile all'index hopping rispetto all'indicizzazione singola.
• I dati interni mostrano tassi di contaminazione ridotti e conversione/cobertura uniforme rispetto ad altri metodi di preparazione delle librerie.

Caratteristiche / specifiche tecniche

• Famiglia di prodotto: adattatori KAPA e accessori.
• Opzioni adattatori: KAPA UDI Adapters (full‑length, 15 µM), KAPA Universal Adapter (troncato, 15 µM), KAPA Universal UMI Adapter (troncato, 33 µM).
• Combinazioni UDI: 96 (KAPA UDI Adapters) o fino a 384 (Universal / UMI con mix di primer).
• Formato barcode: P5 + P7 non ridondanti a 8 nt.
• Configurazione kit: piastre rigide 96‑pozzetti e tubi adattatori con etichettatura adatta all'automazione e sovrariempimenti dove applicabile.
• Consumabili inclusi: Buffer di diluizione adattatore KAPA (25 mL) incluso con kit KAPA UDI; non incluso con adattatori troncati.
• Strumenti previsti: strumenti di sequenziamento Illumina (flow cell patterned e non‑patterned).
• Applicazioni validate: preparazione di librerie NGS DNA e RNA; WGS umano senza PCR se usato con KAPA EvoPrep / KAPA EvoPlus V2; compatibilità RNA EvoPrep come indicato.