Poiché la preparazione dei campioni per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) comporta una moltitudine di fasi e ciascuna di esse è fondamentale per il successo e l'efficienza complessiva del sequenziamento, tutte le fasi devono essere ottimizzate in termini di reagenti e protocollo. Considerando la natura preziosa dei campioni NGS, è necessario un flusso di lavoro integrato con reagenti ottimizzati per convertire i campioni in una libreria pronta per il sequenziamento. I tipi di campioni NGS possono differire in termini di:
Facilità di sequenziamento - uniforme o con strutture secondarie o aree ricche di GC
Qualità - estratto fresco o conservato (formalina fissata paraffina incorporata - FFPE)
Flessibilità dei flussi di lavoro - flussi di lavoro per DNA e RNA ottimizzati per le applicazioni
Tenendo conto di tutte queste variazioni, è importante utilizzare reagenti per la preparazione di librerie in grado di lavorare in modo efficiente con tutti questi tipi di campioni. I reagenti di alta qualità per la preparazione delle librerie aiutano a ottenere una copertura uniforme e migliore, oltre a ridurre i tassi di duplicazione. A seconda dell'obiettivo finale (per esempio, il sequenziamento dell'intero esoma), può essere necessaria anche una fase di arricchimento del target per arricchire specifiche regioni di interesse. L'uso di reagenti ad alta efficienza per l'arricchimento del bersaglio aiuta a ottenere una copertura uniforme e profonda con un'elevata specificità (tasso di on-target) sulle regioni mirate.
Il flusso di lavoro KAPA HyperPETE combina prodotti convalidati sia per la preparazione delle librerie KAPA che per l'arricchimento del target KAPA. Fornisce tutti gli accessori e i reagenti necessari per la preparazione dei campioni, dal DNA o RNA al sequenziatore, in un unico flusso di lavoro giornaliero. I nuovi pannelli KAPA HyperPETE garantiscono un'elevata efficienza di acquisizione, uniformità di sequenziamento con una minore ottimizzazione e una maggiore sicurezza di rilevamento delle varianti.
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