Kit di test oncologico AVENIO CGP V2

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Panoramica
L'AVENIO Tumor Tissue CGP Kit V2 include reagenti per isolare il DNA da tessuto FFPE, preparare librerie di sequenziamento e arricchire le regioni di interesse utilizzando l'AVENIO Tumor Tissue CGP Panel V2. Il kit include l'analisi secondaria basata su cloud (FoundationOne® Analysis Platform) e il software di gestione dati (AVENIO Connect). Utilizza un workflow di cattura ibrida del DNA per il profiling genomico completo di tessuti tumorali solidi FFPE e consente la rilevazione di diverse classi di alterazioni genomiche e firme genomiche complesse.

Applicazione
Test NGS interno a scopo di ricerca (RUO) per il profiling genomico completo dei tumori solidi utilizzando DNA derivato da tessuto FFPE. Progettato per generare informazioni genomiche su varianti a singolo nucleotide (SNV), inserzioni e delezioni (InDels), alterazioni del numero di copie (CNA), riarrangiamenti e firme complesse come Tumor Mutational Burden (TMB), Microsatellite Instability (MSI), genomic Loss of Heterozygosity (gLOH) e la signature di Deficienza nella Ricombinazione Omologa (HRDsig).

Vantaggi principali

• Sfruttare l'esperienza: Basato sulla tecnologia Foundation Medicine e sull'esperienza Roche per fornire profiling genomico completo con ampia esperienza clinica e di ricerca.
• Copertura genomica ampia e completa: Analizza 335 geni rilevanti e più classi di alterazioni oltre a firme genomiche complesse (TMB, MSI, gLOH, HRDsig).
• Workflow NGS rapido e pratico: Un unico workflow dall'estrazione del DNA all'analisi dei dati; preparazione delle librerie in 2 giorni, brevi step di ligazione e tempo di risposta fino a ~5 giorni dall'estrazione del DNA ai risultati.

Prestazioni analitiche
Classificazione - Varianti/firme rilevate
Varianti corte - 99,7%
Riarrangiamenti - 89,9%
CNA - 99,6%
MSI alto - 100%
TMB alto - 100%
gLOH alto - 100%
HRDsig positivo - 91,7%

Informazioni sull'ordine / varianti del kit

• Numero materiale 10240814001 — AVENIO Tumor Tissue CGP Kit A V2 — Piastra A: 24 reazioni — EAN: 07613336230862
• Numero materiale 10240822001 — AVENIO Tumor Tissue CGP Kit B V2 — Piastra B: 24 reazioni — EAN: 07613336230879
• Ogni kit include reagenti per processare fino a 24 reazioni, raggruppabili in due-tre corse di sequenziamento da 8–12 librerie su Illumina NextSeq 500/550 o NextSeq 550 Dx in modalità RUO.

Avvertenza normativa
Solo per uso di ricerca. Non destinato all'uso diagnostico.

Caratteristiche / specifiche tecniche

• Panel: Pannello di 335 geni allineato al design del pannello FoundationOne® CDx; rileva SNV, InDels, riarrangiamenti (RE) e CNA oltre alle firme MSI, TMB, gLOH e HRDsig.
• Tipo di campione: Tessuto FFPE o DNA derivato da tessuto FFPE.
• Reagenti: Reagenti conformi a REACH, senza xilene; confezione da 24 reazioni.
• Compatibilità sequenziamento: Illumina NextSeq 500/550/550Dx (modalità RUO): fino a 12 campioni per flowcell high-output; Illumina NovaSeq 6000 (esplorativo): fino a 24 campioni in flowcell SP o fino a 48 in flowcell S1; supporta multiplexing con campioni non-CGP quando i codici a barre non confliggono.
• Workflow: Workflow manuale basato su cattura ibrida dall'estrazione del DNA alla preparazione e all'arricchimento delle librerie.
• Analisi dei dati: FoundationOne® Analysis Platform per l'analisi secondaria e AVENIO Connect per la gestione dei dati; compatibilità ottimizzata con navify® Mutation Profiler per l'analisi terziaria (opzionale).
• Tempi di risposta: Fino a 5 giorni dall'estrazione del DNA alla generazione dei risultati (workflow tipico e condizioni di sequenziamento descritte da Roche).
• Note analitiche: Le metriche di performance sono derivate dal confronto con FoundationOne® CDx a ~60 milioni di letture per campione (Illumina NextSeq 550) con cutoff definiti per le firme; gli utenti devono determinare i cutoff di firma appropriati al loro uso di ricerca.