Kit di test da ricerca AMPLICON™ HS

di oncologiamolecolareper sequenziamento di DNA in cellula unica

I pannelli HS Swift Amplicon consentono il rilevamento di varianti a bassissima frequenza a e sotto l'1% MAF da 10-20 ng di DNA privo di cellule (cfDNA) per i sequenziatori Illumina®. Gli errori nucleotidici, normalmente introdotti durante la PCR e il sequenziamento, vengono rimossi attraverso l'implementazione di identificatori molecolari unici (MID o UMI) che etichettano in modo univoco i modelli di target durante l'amplificazione. In evidenza - Sensibili e specifici rilevano in modo robusto SNV e indelebili fino allo 0,25% di frequenza dell'allele - Compatibile con cfDNA e FFPE, amplifica da 10-50 ng di cfDNA - Flusso di lavoro veloce, dati di alta qualità Da DNA a biblioteche compatibili con Illumina® entro 3 ore - Strumenti di analisi dei dati accoppiati - basati su cloud o open source I Pannelli HS Swift Amplicon consentono la chiamata di varianti a e sotto l'1% di frequenza, con sensibilità allelica dipendente dalla quantità di materiale in ingresso disponibile e dalla profondità di sequenziamento. Utilizzando 10 ng di DNA in ingresso, questo test rileva costantemente le varianti allo 0,5% con una profondità di sequenziamento raccomandata di almeno 60.000x (1M di lettura) prima della deduplicazione con MID e 0,25% da 20 ng di DNA in ingresso. I Pannelli HS Swift Amplicon facilitano la chiamata di varianti mirate di mutazioni clinicamente rilevanti a meno dell'1% e al di sotto dell'1% frequenza. La tecnologia permette questo tramite l'incorporazione di identificatori molecolari (MID o UMI), che migliorare la sensibilità e la specificità eliminando gli errori falsi positivi introdotti durante la PCR e il sequenziamento. Applicazioni supportate - Oncologia - biopsia liquida cfDNA e tessuto FFPE - Rilevamento genome/ospite - Innesto vs. malattia ospite e fetale in cfDNA materno* - Obiettivi personalizzati* Specifiche Input DNA richiesto e limite di rilevazione 10 ng per la rilevazione dello 0,5%; 20 ng per la rilevazione dello 0,25%