Gli standard di quantificazione delle librerie NGS con primer PCR (per piattaforma illumina) sono stati sviluppati per la quantificazione della concentrazione delle librerie NGS per la piattaforma di sequenziamento illumina. È composto da standard di libreria (sei diluizioni di 10 volte) e da una miscela di primer.
La quantificazione della libreria NGS delle molecole amplificabili è fondamentale per la qualità dei dati di sequenziamento. Un'adeguata concentrazione della libreria massimizza la capacità di sequenziamento. Una scarsa concentrazione della libreria comporta una densità di cluster bassa o alta sulla cella a flusso, che può portare a una bassa capacità di sequenziamento.
Non è preciso misurare la concentrazione della libreria NGS con i metodi standard di quantificazione del DNA, come lo spettrofotometro o il fluorimetro. La QPCR è il metodo migliore per la quantificazione delle librerie con un'elevata coerenza e riproducibilità della quantificazione delle librerie.
Il nostro reagente è una quantificazione altamente sensibile, basata sulla PCR in tempo reale e progettata specificamente per le librerie NGS che utilizzano la piattaforma di sequenziamento illumina. L'amplificazione utilizza sequenze di adattatori illumina come primer e solo le librerie completamente legate agli adattatori vengono amplificate. Pertanto, il reagente fornisce una stima accurata della concentrazione della libreria basata su librerie illumina realmente sequenziabili. Inoltre, questo kit può essere utilizzato anche per la conferma della reazione di ligazione dopo il completamento della preparazione della libreria.
I nostri standard di quantificazione delle librerie sono compatibili con i reagenti QPCR commerciali basati su SYBR Green. Ciò lo rende più flessibile per gli scienziati che desiderano utilizzare i loro reagenti per la PCR in tempo reale. La quantificazione della concentrazione della libreria si ottiene mediante confronto con una curva standard generata dagli standard della libreria.
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