Il kit di preparazione delle librerie RNA Seq è stato sviluppato per la costruzione di librerie NGS di alta qualità per il sequenziamento di nuova generazione (piattaforme illumina e MGI). Il sequenziamento dell'RNA è uno strumento molto potente per analizzare il trascrittoma, come l'espressione genica e la regolazione della trascrizione, la caratterizzazione dello splicing, l'individuazione di mutazioni e variazioni, ecc. Il kit necessita di RNA purificato (ad esempio, RNA depleto di rRNA o mRNA polyA) come input per la costruzione della libreria. La multiplazione delle librerie è possibile con diversi tipi di indici.
Per i kit della piattaforma illumina sono disponibili tre tipi di indici:
Non indice: le librerie non hanno indice.
Index : una sequenza di codice a barre unica di 6 basi è stata inclusa in ciascuno dei primer index. Il multiplexing delle librerie di sequenziamento dell'RNA è possibile con un massimo di 48 campioni. Le informazioni sull'indice possono essere scaricate qui.
Doppio indice unico: il multiplexing di librerie di RNA Sequencing fino a 96 campioni è possibile con i doppi indici unici. Abbiamo sviluppato un sistema di indici a differenza di 4 basi. Il sistema è in grado di generare indici con almeno 4 basi diverse dagli altri nella regione di indicizzazione a 8 basi. I primer unici a doppia indicizzazione identificano gli errori di sequenziamento come il salto di indice, l'assegnazione errata e gli errori di de-multiplexing. Le informazioni sugli indici possono essere scaricate qui.
Gli indici sono disponibili per i kit della piattaforma MGI.
Caratteristiche
Protocollo rapido
Le librerie sono pronte in 2 ore
Il tempo di utilizzo è di soli ~10 minuti
Qualità garantita
Alta resa
Copertura uniforme delle trascrizioni
Flusso di lavoro semplice
Quantità di RNA purificato in ingresso: Da 3 ng a 100 ng
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