Il kit di preparazione delle librerie di DNA NGS senza PCR è stato sviluppato per la costruzione di librerie di DNA per il sequenziamento di nuova generazione (piattaforma illumina). Il kit aggiunge in modo efficiente adattatori di libreria con coda 3′-dT a entrambe le estremità dei frammenti di DNA. Il kit utilizza frammenti di DNA a doppio filamento (smussati e/o appiccicosi) come DNA di input per la costruzione di librerie NGS ed è compatibile con frammenti di DNA generati da metodi enzimatici (enzimi di frammentazione del DNA BioDynami, ecc.) e fisici (sonicazione, nebulizzazione, ecc.)
L'amplificazione PCR è una fase standard per la preparazione delle librerie di sequenziamento di nuova generazione. La PCR viene utilizzata per amplificare i frammenti di DNA completamente ligati e per aggiungere informazioni di indicizzazione alle librerie. L'indicizzazione serve a raggruppare i campioni delle librerie nel tentativo di ridurre i costi di sequenziamento.
Tuttavia, la PCR introduce un'amplificazione non uniforme del DNA in alcune regioni del DNA con contenuti GC e strutture secondarie estreme. Questo bias può causare una copertura di sequenziamento molto bassa in tali regioni. Il sequenziamento del DNA in queste regioni è ancora una grande sfida.
La preparazione delle librerie senza PCR può ridurre il bias delle librerie e minimizzare le lacune di sequenziamento. I dati di sequenziamento provenienti da campioni di libreria privi di PCR presentano una copertura genomica uniforme con poche lacune e una migliore profondità nelle regioni ricche di GC. Il nostro kit NGS senza PCR offre una copertura ottimale nelle regioni tradizionalmente difficili, come le regioni ad alto contenuto di GC, le regioni a basso contenuto di GC e le regioni a sequenza ripetitiva.
Per il kit sono disponibili due tipi di indice:
Non indice: Le librerie non hanno indice.
Indice: Ogni libreria contiene un indice i5 e un indice i7. È possibile la multiplazione delle librerie fino a 96 campioni. L'elenco degli indici può essere scaricato qui.
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