AmpliSeq for Illumina Focus Panel è un saggio di risequenziamento mirato per l'analisi dei biomarcatori di 52 geni di nota rilevanza per i tumori solidi. Utilizzando il Focus Panel, i ricercatori possono analizzare contemporaneamente sia il DNA che l'RNA. Le caratteristiche principali includono:
Contenuto genico rilevante
Biomarcatori target su 52 geni rilevanti per i tumori solidi
Flusso di lavoro rapido e semplificato
Preparazione di librerie pronte per il sequenziamento in un solo giorno da appena 1 ng di campioni di alta qualità o 10 ng di campioni di input fissati in formalina e inclusi in paraffina (FFPE)
Dati accurati
Rilevamento di mutazioni somatiche con frequenza fino al 5% mediante analisi locale o in cloud
Il pannello Focus fa parte di un flusso di lavoro integrato che comprende la preparazione delle librerie basata sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) di AmpliSeq for Illumina, la tecnologia di sequenziamento di nuova generazione (NGS) Illumina mediante sintesi (SBS) e l'analisi automatizzata.
Questo pannello pronto all'uso consente di risparmiare tempo e fatica nell'identificazione dei target, nella progettazione dei primer e nell'ottimizzazione dei pannelli.
Specifiche tecniche
Tempo di analisi - 5-6 ore (solo preparazione delle librerie; non include la quantificazione delle librerie, la normalizzazione o il tempo di pooling)
Tipo di cancro - Tumore solido
Descrizione - Ricerca di analisi somatica su 52 geni associati a tumori solidi.
Tempo di lavoro - < 1,5 ore
Quantità in ingresso - 1-100 ng (10 ng raccomandati per pool)
Numero di ampliconi - 553 in totale. 2 pool. (Pool DNA: 269 ampliconi. Pool RNA: 284 ampliconi)
Tipi di campioni specializzati - Tessuto FFPE
Classe di varianti - Polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), Fusioni geniche, Varianti somatiche, Inserzioni-delezioni (indel), Varianti del numero di copie (CNV)
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