AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 è un saggio di risequenziamento mirato per la ricerca di mutazioni somatiche nelle regioni hotspot di 50 geni con associazioni note al cancro, identificati nel database Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)1 . Le caratteristiche principali includono:
Contenuto genico rilevante
Target ~2800 mutazioni COSMIC da 50 oncogeni e geni soppressori del tumore
Flusso di lavoro rapido e semplificato
Preparazione di librerie pronte per il sequenziamento in un solo giorno da appena 1 ng di campioni di alta qualità o 10 ng di campioni fissati in formalina, inclusi in paraffina (FFPE)
Dati accurati
Rilevamento di mutazioni somatiche fino al 5% di frequenza allelica delle varianti mediante analisi locale o in cloud
Il pannello Cancer HotSpot fa parte di un flusso di lavoro integrato che comprende la preparazione delle librerie basata sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) di AmpliSeq for Illumina, la tecnologia di sequenziamento di nuova generazione (NGS) Illumina mediante sintesi (SBS) e l'analisi automatizzata.
Questo pannello consente di rilevare varianti altamente sensibili in diversi tipi di cancro, tra cui polmone, colon, mammella, ovaio, melanoma e prostata. Il pannello pronto all'uso consente di risparmiare il tempo e l'impegno necessari per identificare i target, progettare i primer e ottimizzare i pannelli.
Specifiche tecniche
Tempo di analisi - 5 ore (solo preparazione delle librerie; non include la quantificazione delle librerie, la normalizzazione o il tempo di pooling)
Tipo di cancro - Pan-cancro, tumore solido
Specifiche del contenuto - Regioni hotspot di 50 geni con associazioni note al cancro
Descrizione - Ricerca di analisi somatica sulle regioni hotspot di 50 geni correlati al cancro.
Tempo di lavoro - < 1,5 ore
Quantità in ingresso - 1-100 ng (10 ng raccomandati per pool)
---