AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 è un saggio di risequenziamento mirato per la ricerca di mutazioni somatiche nelle regioni hotspot di 50 geni con associazioni note al cancro, identificati nel database Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)1 . Le caratteristiche principali includono:
Contenuto genico rilevante
Target ~2800 mutazioni COSMIC da 50 oncogeni e geni soppressori del tumore
Flusso di lavoro rapido e semplificato
Preparazione di librerie pronte per il sequenziamento in un solo giorno da appena 1 ng di campioni di alta qualità o 10 ng di campioni FFPE (formalin-fixed, paraffin-embedded)
Dati accurati
Rilevamento di mutazioni somatiche fino al 5% di frequenza allelica delle varianti mediante analisi locale o basata su cloud
Il pannello Cancer HotSpot fa parte di un flusso di lavoro integrato che comprende la preparazione delle librerie basata sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) di AmpliSeq for Illumina, la tecnologia di sequenziamento di nuova generazione (NGS) Illumina mediante sintesi (SBS) e l'analisi automatizzata.
Questo pannello consente di rilevare varianti altamente sensibili in diversi tipi di cancro, tra cui polmone, colon, mammella, ovaio, melanoma e prostata. Il pannello pronto all'uso consente di risparmiare tempo e fatica nell'identificazione dei target, nella progettazione dei primer e nell'ottimizzazione dei pannelli.
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