Il pannello AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 offre una copertura dei geni chiave del cancro, compresi i domini delle chinasi e i geni coinvolti nella riparazione del DNA.
Contenuto genico rilevante
Target di 161 geni unici associati al cancro
Flusso di lavoro rapido e semplificato
Preparazione di librerie pronte per il sequenziamento in un solo giorno a partire da appena 1 ng di campioni di alta qualità o 10 ng di campioni di input fissati in formalina e inclusi in paraffina (FFPE)
Dati accurati
Rilevamento di mutazioni somatiche con una frequenza fino al 5% mediante analisi locale o su cloud
Il pannello completo v3 fa parte di un flusso di lavoro integrato che comprende la preparazione delle librerie basata sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) di AmpliSeq for Illumina, la tecnologia di sequenziamento di nuova generazione (NGS) Illumina mediante sintesi (SBS) e l'analisi automatizzata.
Il contenuto del pannello comprende regioni hotspot, geni a lunghezza intera, geni con numero di copie e fusioni geniche inter- e intrageniche. Questo pannello pronto all'uso consente di risparmiare tempo e fatica nell'identificazione dei target, nella progettazione dei primer e nell'ottimizzazione dei pannelli.
Specifiche tecniche
Tempo di analisi: 5-6 ore (solo per la preparazione delle librerie; non include la quantificazione delle librerie, la normalizzazione o il tempo di pooling)
Tipo di cancro - Tumore solido
Specifiche del contenuto - bersagli di DNA e RNA per 161 oncogeni
Descrizione - Ricerca di analisi somatica sui target hotspot e full-length di geni* associati ai tumori solidi.
Tempo di lavoro - <1,5 ore
Quantità in ingresso - 1-100 ng (10 ng raccomandati per pool)
Multiplexing - 96 combinazioni a doppio indice
Classe di varianti - Polimorfismi a singolo nucleotide (SNP), Fusioni geniche, Varianti somatiche, Inserzioni-delezioni (indel), Varianti del numero di copie (CNV)
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