Software per sequenziamento NGS NextGENe®

di analisida laboratorio

Il software NextGENe è il partner analitico perfetto per l'analisi dei dati di sequenziamento desktop prodotti dai sistemi Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq e NovaSeq, dai sistemi Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM e Proton e da altre piattaforme. Il software NextGENe viene eseguito su un sistema operativo Windows®, che offre un'interfaccia "point & click" di facile utilizzo per i biologi. Non richiede scripting o altri supporti bioinformatici, spesso necessari quando si utilizzano programmi come CLC Genomics Workbench, Lasergene SeqMan Pro e software accademici come MAQ & SOAP, Top Hat, BWA e Bowtie. Il software NextGENe impiega tecnologie uniche e specifiche della piattaforma in un unico pacchetto multi-applicazione indipendente. Il software NextGENe contiene moduli di analisi per: Rilevamento di SNP/Indel Germinale Somatico Cattura dell'esoma, sequenziamento dell'intero esoma (WES) Sequenziamento dell'intero genoma (WGS) Analisi delle varianti strutturali (compreso il rilevamento dei geni di fusione) Confronti tra famiglie e trio Confronto tumore-normale Rilevamento delle variazioni del numero di copie (CNV) e screening alternativo a quello MLPA assemblaggio de novo Trascrittoma; analisi dello splicing alternativo e livelli di espressione trascrizionale ChIP-Seq, Espressione genica digitale (DGE), Analisi e quantificazione dei miRNA e Metagenomica Il software NextGENe è stato progettato in un ambiente Windows® facile da usare per i biologi, riducendo in modo significativo la necessità di risorse bioinformatiche aggiuntive e i costi. Il software NextGENe utilizza un hardware a basso costo basato sul sistema operativo Windows a 64 bit. (Fare clic qui per la configurazione hardware suggerita)