La glicosilazione è un processo enzimatico in cui gruppi di carboidrati vengono attaccati alla spina dorsale di proteine o lipidi. La glicosilazione delle proteine è una delle modifiche post-traslazionali più comuni e si riscontra in tutti gli organismi viventi. Influenza processi come il ripiegamento delle proteine, la stabilità e l'organizzazione delle membrane. I kit ProMoSCOPE™ per il rilevamento della glicosilazione a livello di singola cellula consentono di quantificare accuratamente il livello di glicosilazione della superficie cellulare insieme ai profili di espressione genica a livello di singola cellula. Si ottiene con un metodo chemioenzimatico in cui il tag ProMoSCOPE si lega covalentemente alla N-acetilcitosamina (LacNAc) sulla superficie cellulare. Il livello di glicosilazione, insieme alle informazioni sull'intero trascrittoma, può essere utilizzato per un'analisi approfondita dello stato e delle funzioni delle cellule in sistemi biologici complessi.
Il kit ProMoSCOPE™ per il rilevamento della glicosilazione di una singola cellula utilizza lo SCOPE-chip®, un chip microfluidico portatile con micropozzetti che integra più fasi del flusso di lavoro di elaborazione, come la cattura di una singola cellula, la lisi cellulare e la cattura dell'mRNA cellulare. Le librerie pronte per il sequenziamento possono essere preparate con i reagenti inclusi. Lo SCOPE-chip® è facile da usare e può essere utilizzato manualmente senza attrezzature speciali. È adatto a cellule provenienti da un'ampia varietà di tipi di tessuto.
Il timo dei topi viene estratto e le sospensioni di cellule singole, etichettate e non, vengono caricate sullo SCOPE-chip® e processate con il ProMoSCOPE™ Single Cell Glycosylation Detection Kit. Le cellule sono annotate nel grafico UMAP e mostrate in (A). Il grafico UMAP colorato in base al trattamento è mostrato in (B).
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