Kit di reagenti in soluzione FocuSCOPE™

per rilevamento di mutazioniper sequenziamento di RNA in cellula unicagenetico

FocuSCOPE™ è una soluzione di sequenziamento multiomico ad alta produttività per singole cellule in grado di rilevare sia le varianti genetiche che il trascrittoma dalle stesse cellule. FocuSCOPE™ ha quindi fornito uno strumento per decifrare la connessione tra genotipo e fenotipo a livello di singola cellula. La tecnologia FocuSCOPE™ si basa su due elementi chiave: microparticelle di codifica cellulare coniugate con oligo in grado di catturare in modo efficiente sia l'mRNA che le sequenze di interesse; e una chimica di reazione ottimizzata per l'amplificazione e la costruzione di librerie sia di sequenze di mRNA che di sequenze di regioni target. FocuSCOPE™ è stato utilizzato per eseguire con successo analisi su singola cellula di profili di espressione genica e di mutazioni puntiformi, geni di fusione o sequenze virali intracellulari simultaneamente, da migliaia di cellule alla volta. I dati multiomici acquisiti hanno fornito una visione più completa di ogni singola cellula. Perle uniche e personalizzate Con le microsfere AccuraCellTM di Singleron, dal design unico, è possibile catturare simultaneamente fino a 5 aree mirate, ciascuna inferiore a 200 bp. Dallo stesso campione vengono costruite due librerie, una per la trascrittomica completa con le sonde poly (dT) e una per le sequenze mirate con sonde personalizzate. Pertanto, le informazioni sul tipo di cellula e le sequenze mirate (mutazioni, geni di fusione o sequenze virali) possono essere rilevate nella stessa cellula. Rilevamento specifico delle mutazioni driver I kit FocuSCOPE® rilevano le mutazioni driver da tessuti eterogenei con elevata specificità. In un set di dati dimostrativi qui sotto, provenienti da una miscela di tre linee cellulari, la linea cellulare H1975 presenta la mutazione puntiforme EGFR T790M e la linea cellulare A549 la mutazione KRAS G12S.