Il sequenziamento di RNA monocellulare richiede solitamente come input una sospensione di cellule singole preparata da campioni freschi. Per il sequenziamento di singole cellule di tessuti congelati, offriamo un prodotto specializzato, il GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit. Il GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit è una soluzione completa per trasformare i tessuti in nuclei singoli e convertire l'mRNA contenuto nei nuclei singoli in librerie NGS.
Il GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit può essere utilizzato non solo per analizzare campioni di tessuto congelati, ma anche per il sequenziamento di singoli nuclei di cellule congelate isolate mediante FACS sorting. Inoltre, il GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit può essere utilizzato anche per l'analisi di singole cellule di grande diametro o di forma irregolare, come i neuroni.
Esempio di set di dati sperimentali
Il tessuto congelato dell'ippocampo di un cervello di topo è stato trattato con il kit GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library. Dopo l'isolamento del nucleo, la suddivisione e la codifica a barre, è stata sequenziata una libreria di nuclei singoli e i dati ottenuti sono stati raggruppati. Sulla base dei profili di espressione dei geni marcatori, sono stati annotati i principali sottotipi cellulari (neuroni eccitatori, neuroni inibitori, cellule gliali, neuroblasti e oligodendrociti) utilizzando il database SynEcoSys.
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