Kit di reagenti in soluzione CLindex™

per preparazione di banche del DNAdi preparazione di banche di RNA

CLindex™Il kit di multiplazione dei campioni consente di raggruppare fino a 16 campioni nella stessa libreria di sequenziamento monocellulare. La tecnologia di multiplexing CLindex™ impiega la chimica dei clic per un'etichettatura efficiente e imparziale dei campioni. Un gruppo chimico con un'elevata affinità per le proteine della superficie cellulare e un oligo di indicizzazione del campione che si lega a tale gruppo chimico etichettano le cellule di ciascun campione. Uno dei principali vantaggi dell'etichettatura basata sulla chimica dei clic rispetto a quella basata sugli anticorpi è che le proteine della superficie cellulare riconosciute dalla chimica dei clic sono abbondanti e presenti in diverse specie. Inoltre, l'intero processo di etichettatura dei campioni richiede solo 30 minuti. Flusso di lavoro semplificato I tag dei campioni vengono aggiunti con la chimica dei clic prima del raggruppamento dei campioni in un unico flusso di lavoro GEXSCOPE® . Le cellule raggruppate con i tag del campione vengono poi caricate su uno SCOPE-chip™ per la lisi cellulare e la codifica a barre. Il tag del campione (15nt) è affiancato da un handle PCR universale e da una coda di poli(A), che vengono catturati da microsfere di oligo-dT. I tag del campione sono etichettati con un codice a barre cellulare. Contemporaneamente, anche gli mRNA della stessa singola cellula vengono catturati dalle microsfere magnetiche di oligo-dT in corrispondenza della loro coda di poli(A) e marcati con lo stesso codice a barre cellulare e con l'UMI. Pertanto, tutti i frammenti di cDNA provenienti dalla stessa cellula hanno un denominatore comune: il codice a barre cellulare. Sia il codice a barre cellulare che il tag CLindex assicurano che ogni trascritto possa essere ricondotto alla cellula e al campione di origine. Alta efficienza di etichettatura Quattro linee cellulari indipendenti (NB4, THP1, U937 e CCRF) sono state etichettate con CLindex® e raggruppate in parti uguali prima della suddivisione delle cellule sullo SCOPE-chip®.