Kit flessibile per il sequenziamento mirato e il barcoding molecolare
Identificazione di trascrizioni di fusione note e sconosciute
Uso di primer specifici del gene progettati su misura per la sintesi del primo
e/o la sintesi del secondo filamento
Alternativa economica e flessibile ai pannelli di sequenziamento pre-progettati
Sequenziamento di un massimo di 9.126 campioni per corsia
Il QuantSeq-Flex Kit è un protocollo di preparazione della libreria progettato per fare Illumina librerie compatibili da qualsiasi campione di RNA utilizzando primer personalizzati. E 'aperto per lo sviluppo da parte degli utenti avanzati RNA-Seq in base alle loro esigenze personalizzate.
Il kit si basa sulla strategia QuantSeq FWD Kit per Illumina (Cat. No. 015), con reagenti compatibili e Read 1 sequenza linker introdotto dal primer di sintesi del secondo filamento. Quindi le letture generate durante la corsa NGS corrispondono direttamente alla sequenza di RNA.
Il kit QuantSeq-Flex fornisce moduli per la trascrizione inversa (RT) e la SSS, permettendo agli utenti di scegliere i propri primer per uno di questi passaggi o per entrambi. Questo offre la massima flessibilità nella scelta dei target e del materiale di input.
Con questo kit QuantSeq altamente flessibile è possibile generare i seguenti tipi di librerie:
1.) OligodT primed nella trascrizione inversa, random primed nella sintesi del secondo filamento (QuantSeq 3' mRNA-Seq)
2.) OligodT primed nella trascrizione inversa, primed specifico per il target nella sintesi del secondo filamento (targeted 3' mRNA-Seq)
3.) Adescamento specifico del target nella trascrizione inversa, adescamento casuale nella sintesi del secondo filamento (RNA-Seq mirato, permette l'identificazione di nuove fusioni)
4.) Innescato in modo specifico nella trascrizione inversa, innescato in modo specifico nella sintesi del secondo filamento (RNA-Seq mirato, solo target noti rilevabili)
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