Kit di reagenti in soluzione QuantSeq

per preparazione di campioniper acidi nucleiciNGS

Analisi dell'espressione genica a livello di genoma efficiente in termini di costi Risparmio della profondità di sequenziamento generando solo un frammento per trascrizione Protocollo all-in-one semplice e veloce: meno di 4,5 ore Adatto a bassi input (1 ng di RNA totale) e a campioni FFPE Pipeline di analisi dei dati gratuita per i non bioinformatici Disponibilità di UMI per il rilevamento di duplicati PCR NUOVO! Bundle con fino a 384 indici doppi unici (UDI) Il QuantSeq FWD Kit è un protocollo di preparazione delle librerie progettato per generare librerie compatibili con Illumina di sequenze vicine all'estremità 3' dell'RNA poliadenilato. QuantSeq FWD contiene la sequenza Illumina Read 1 linker nel primer di sintesi del secondo filamento, quindi le letture NGS sono generate verso la coda poly(A), riflettendo direttamente la sequenza di mRNA (vedi flusso di lavoro). Questa versione è lo standard raccomandato per l'analisi dell'espressione genica. Lexogen fornisce inoltre una versione ad alta produttività con doppia indicizzazione opzionale (indici i5 e i7) che consente di multiplexare fino a 9.216 campioni in una corsia. Mappatura dei siti finali di trascrizione Utilizzando letture più lunghe, QuantSeq FWD permette di individuare esattamente l'estremità 3' dell'RNA poli(A) (vedi Fig. 3) e quindi di ottenere informazioni accurate sull'UTR 3'. Analisi di campioni a basso input e di bassa qualità La quantità raccomandata di RNA totale in ingresso è di appena 1 ng. QuantSeq è adatto a generare in modo riproducibile librerie da RNA di bassa qualità, compresi i campioni FFPE. Vedere le Fig. 1 e 2 per un confronto tra due diverse qualità di RNA (FFPE e cryo-block fresco congelato) dello stesso campione.