Modulo software per sequenziamento HLA SEQHLA

da laboratoriodi analisi

SEQHLA è un'applicazione potente e di facile utilizzo per l'analisi dei dati di tipizzazione basati sulla sequenza HLA provenienti da tutte le piattaforme di sequenziamento Sanger. Tutte le versioni del database IMGT HLA sono disponibili per il download e l'importazione. Utilizza un esclusivo sistema di apprendimento delle basi basato sui dati statistici dell'area di picco e dispone di una funzione di modifica automatica. Se si desidera, le posizioni costanti possono essere ignorate per l'analisi. Il risultato può essere visualizzato con risoluzione massima, a 1 o 2 campi e come codice NMPD. Tutti i dati dei risultati possono essere trasferiti ai sistemi LIM interni del laboratorio e/o emessi come referti personalizzati per i pazienti. Compatibile con i dati provenienti da tutte le piattaforme e i kit di sequenziamento Sanger più comuni Facile impostazione di singole regioni target basate sul database IMGT HLA Chiamata di basi configurabile con soglie dipendenti dal sequenziatore Taglio automatico e definito dall'utente dei file dei risultati del sequenziamento Tutti i risultati di un paziente sono visualizzati in un'unica schermata, comprese le combinazioni alleliche rilevate Avviso automatico per le mutazioni del sito di splice Possibilità di ignorare le posizioni costanti per l'analisi Rilevamento di nuovi alleli Visualizzazione dei risultati in diverse risoluzioni (1 campo, 2 campi e risoluzione massima) e come codice NMDP Statistica dell'area di picco: confronto automatico con tutti i campioni analizzati in precedenza per un rilevamento sensibile delle posizioni eterozigote anche in caso di abbandono allelico Rapporto HLA dettagliato per singoli pazienti/ordini