Pronti all'uso: I tamponi preassemblati consentono una preparazione fulminea delle librerie in appena 4 ore senza compromettere la qualità.
Prestazioni migliorate: Preparate librerie con una contaminazione mitocondriale 7 volte inferiore, risparmiando letture e aumentando la profondità di sequenziamento.
Eccezionale coerenza: Produce repliche altamente correlate da campioni freschi e congelati.
DESCRIZIONE
Il kit di librerie Zymo-Seq ATAC fornisce un flusso di lavoro semplice e snello per la preparazione di librerie ATAC-Seq (Assay for Transposase Accessible Chromatin with high throughput Sequencing) da cellule e tessuti di mammifero. Questo kit all-inclusive presenta un protocollo facile da seguire, in grado di preparare librerie ATAC-Seq da 50.000 cellule in sole 4 ore, con un tempo di lavoro minimo.
La lisi cellulare iniziale è delicata e garantisce che mentre i nuclei importanti vengono centrifugati dalla cellula lisata e raccolti, il DNA mitocondriale contaminante rimane all'interno della cellula e viene scartato. Successivamente, la trasposasi, precaricata con gli adattatori Illumina, frammenta e tagga simultaneamente le regioni di cromatina aperte in un'unica rapida reazione. Infine, il DNA taggato viene indicizzato e amplificato tramite PCR con il set di primer UDI Tag, generando librerie di alta qualità pronte per essere sequenziate su qualsiasi strumento Illumina.
Input di DNA - Per ottenere risultati ottimali, utilizzare 50.000 cellule per replica tecnica. Le cellule devono presentare una vitalità (misura della proporzione di cellule vive all'interno di una popolazione) >80%. Si consiglia di utilizzare un contatore di cellule per misurare accuratamente la vitalità.
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