Kit di reagenti a biglie magnetiche SMARTer®

per sequenziamento di RNA in cellula unicadi proteine

SMARTer Target RNA Capture per Illumina è un sistema completo progettato per generare cDNA da RNA totale arricchito. L'RNA-seq mirato può superare diverse sfide inerenti agli esperimenti di RNA-seq con amplificazione dell'intero trascrittoma (WTA), migliorando la copertura della sequenza e la sensibilità di rilevamento dei trascritti di interesse che possono essere presenti in basse quantità. Gli approcci RNA-seq mirati sono vantaggiosi anche per il risparmio dei costi e la semplificazione dell'analisi. L'arricchimento dei trascritti di interesse prima della sintesi del cDNA consente di acquisire informazioni su trascritti che altrimenti potrebbero sfuggire o che richiedono un numero molto maggiore di letture di sequenziamento per essere rilevati, tra cui fusioni di geni chimerici, isoforme di trascritto e varianti di splice. Migliorando la sensibilità, si migliora anche la potenza dell'analisi, come dimostra la riduzione del rapporto segnale/rumore. Nel flusso di lavoro SMARTer Target RNA Capture for Illumina, l'RNA totale viene ibridato con sonde di DNA biotinilate progettate dall'utente in meno di quattro ore e quindi purificato prima della cattura su Capture Beads, particelle magnetiche rivestite di streptavidina. Le Capture Beads sono state selezionate perché presentano un adsorbimento particolarmente basso di proteine e acidi nucleici e non interferiscono con le reazioni a valle, come la PCR o la trascrizione inversa, consentendo di eseguire la sintesi del cDNA sui campioni mirati mentre questi rimangono attaccati alle perle. Le microsfere di cattura sono fornite come parte del kit SMARTer Target RNA Capture for Illumina e sono vendute anche separatamente.