Il pannello di deplezione dell'RNA DepleteX rimuove i trascritti insulinici a più alta espressione in vitro prima del sequenziamento, ridistribuendo i cluster di sequenziamento su trascritti unici biologicamente rilevanti, consentendo di massimizzare l'UMI e la sensibilità genica.
Al di là della deplezione delle costole, i campioni di RNA presentano in genere un numero ridotto di trascritti altamente espressi e ben caratterizzati, la cui risequenziazione aggiunge poche informazioni biologicamente rilevanti. Purtroppo, questi trascritti altamente espressi competono con quelli a bassa espressione per la copertura del sequenziamento. Questa mancanza di copertura di sequenziamento, unita al rumore significativo dei trascritti ad alta espressione, limita l'individuazione dei geni a bassa espressione, delle varianti rare e degli eventi di fusione unici che possono essere alla base delle malattie.
Punti salienti
Pannello per l'insulina progettato per eliminare i trascritti sovraespressi nei campioni di pancreas
Riassegnare le letture di sequenziamento ai trascritti a bassa espressione per una maggiore copertura
Massimizzare l'individuazione di varianti e isoforme con un minor numero di sequenziamenti
Informazioni su
Il kit contiene RNA guida specifico per ogni tessuto e reagenti di deplezione per la deplezione post-librativa
Specificazioni
Campioni per kit - 24
Tessuti valutati nel progetto - Pancreas
Progettato per eliminare - 2 geni dell'insulina
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