Kit di reagenti in soluzione KIT1020

per deplezione del DNA

Il nostro kit DepleteX High Expressing RNA Depletion rimuove i trascritti a più alta espressione in vitro prima del sequenziamento, ridistribuendo il ~70%* delle letture di sequenziamento su trascritti unici biologicamente rilevanti, consentendo di massimizzare la rilevazione di trascritti a bassa espressione o isoforme rare. Aumenta la sensibilità di rilevamento nei fibroblasti e nel sangue intero Il risequenziamento dei trascritti ad alta espressione aggiunge poche informazioni biologicamente rilevanti. Purtroppo, questi trascritti competono con quelli a bassa espressione per la copertura del sequenziamento. Questa mancanza di copertura, unita al rumore significativo dei trascritti ad alta espressione, limita il rilevamento dei geni a bassa espressione, delle varianti rare e degli eventi di fusione unici che possono essere alla base delle malattie. DepleteX si avvale di Cas9 e di un set di RNA guida progettato per rimuovere il 70% dei trascritti ad alta espressione da librerie RNA-Seq selezionate con poli-A e derivate da fibroblasti e sangue intero. Questo set di guida è stato progettato per massimizzare la riassegnazione delle letture di sequenziamento totali e aumentare la copertura di sequenziamento di trascritti rari e a bassa espressione e di eventi di fusione unici. Punti salienti Eliminazione di >4.000 trascritti altamente espressi nel sangue intero e nei fibroblasti Assegnazione di ~70%* di letture in più a trascritti biologicamente rilevanti a bassa espressione Massimizzare il rilevamento di varianti e isoforme con un minor numero di sequenziamenti Maggiore rilevamento di trascritti a bassa espressione Integrazione facile nel flusso di lavoro con un protocollo semplice e flessibile Informazioni su Il kit include l'RNA guida e i reagenti di deplezione per la deplezione post-librativa. Specifiche Campioni per kit - 24 Tessuti valutati nel progetto - Fibroblasti, sangue intero Contenuto di deplezione - ~4.450 trascritti ad alta espressione