Il kit di deplezione della globina DepleteX rimuove in vitro quattro trascritti della globina altamente espressi prima del sequenziamento, ridistribuendo i cluster di sequenziamento su trascritti unici biologicamente rilevanti, consentendo di massimizzare l'UMI e la sensibilità del gene.
Al di là della deplezione delle costole, i campioni di RNA presentano in genere un numero ridotto di trascritti altamente espressi e ben caratterizzati, il cui sequenziamento aggiunge poche informazioni biologicamente rilevanti. Purtroppo, questi trascritti altamente espressi competono con quelli a bassa espressione per la copertura del sequenziamento. Questa mancanza di copertura di sequenziamento, unita al rumore significativo dei trascritti ad alta espressione, limita l'individuazione dei geni a bassa espressione, delle varianti rare e degli eventi di fusione unici che possono essere alla base delle malattie.
Punti salienti
Semplice deplezione imparziale della globina umana dalle librerie RNA-Seq
Ottenere una deplezione >99% della globina contaminante
Incubazione rapida di un'ora per la deplezione
Circa
Kit progettato per la deplezione di quattro geni globinici umani (HBA1, HBA2, HBB, HBD)
Specifiche
Campioni per kit - 24
Tessuti valutati nel progetto - Sangue
Progettato per eliminare - HBA1, HBA2, HBB e HBD
Compatibilità del prodotto CRISPRclean - Deplezione di una singola cellula e ribodeplezione
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