Kit di reagenti in soluzione TruSight

da ricercaper sequenziamento di DNAoncologico

Sviluppati in collaborazione con esperti di genomica del cancro, questi oligo pre-progettati e pronti all'uso consentono ai ricercatori di sequenziare una serie di geni e polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) precedentemente collegati alla predisposizione al cancro. Si rivolge a 94 geni e 284 SNP associati a una predisposizione al cancro TruSight Cancer include geni associati a tumori comuni (ad esempio, seno e colon-retto) e rari. Inoltre, il set include 284 SNPs trovati in correlazione con il cancro attraverso studi di associazione genome-wide (GWAS). La selezione dei contenuti si è basata sulla curatela di esperti della letteratura scientifica e di altre risorse di alta qualità. Il pannello di sequenziamento TruSight Cancer fornisce oligo personalizzati mirati alle regioni di interesse identificate. Viene fornita una quantità di prodotto sufficiente per quattro reazioni di arricchimento. TruSight Cancer è compatibile con TruSight Rapid Capture. Set di dati dei campioni di TruSight Cancer 6 campioni di riferimento umani sono stati preparati utilizzando il pannello di sequenziamento TruSight Cancer. Queste librerie sono state sequenziate sul sistema MiniSeq utilizzando un kit ad alto rendimento con una configurazione di lunghezza di lettura di 2 x 100 bp con doppia indicizzazione. La resa totale è stata di 5,2 Gb con il 95,8% di basi a Q30 o superiori. Specifiche tecniche Tempo di analisi - 1,5 giorni Tipo di cancro - Pan-cancro Specifiche del contenuto - Set fisso di sonde che arricchiscono per 94 geni e 284 SNP associati a tumori comuni e rari. Descrizione - Ricerca di mutazioni germinali per tumori comuni e rari. Tempo di utilizzo - 5 ore Quantità in ingresso - 50 ng di DNA Strumenti - Sistema MiSeq, Sistema NextSeq 550, MiSeqDx in modalità ricerca, Sistema MiniSeq, Sistema NextSeq 500 Metodo - Sequenziamento mirato del DNA, arricchimento del target Multiplexing - Fino a 96 multiplex