AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel è un pannello di risequenziamento mirato altamente multiplexato per misurare la diversità delle cellule T e l'espansione clonale mediante il sequenziamento dei riarrangiamenti della catena beta del recettore delle cellule T (TCR). Utilizza un unico pool di primer PCR multiplex, reagenti per librerie e codici a barre dei campioni, per generare librerie da RNA estratto da sangue intero, tessuti freschi e congelati o cellule selezionate al FACS. Le caratteristiche principali includono:
Contenuto di alto valore
Copertura completa delle sequenze della catena beta del TCR
Flusso di lavoro rapido e semplificato
Preparazione di librerie pronte per il sequenziamento in un solo giorno da sangue intero, tessuto fresco/congelato o cellule con selezione cellulare attivata da fluorescenza (FACS)
Basso requisito di input
Generazione di librerie di sequenziamento di alta qualità da appena 10 ng di RNA in ingresso
Il pannello Immune Repertoire Plus, TCR beta fa parte di un flusso di lavoro integrato che comprende AmpliSeq per la preparazione di librerie basate sulla reazione a catena della polimerasi (PCR) Illumina, il sequenziamento per sintesi (SBS) Illumina, la tecnologia NGS e l'analisi automatizzata.
Questo pannello pronto all'uso consente di risparmiare tempo e fatica nell'identificazione dei target, nella progettazione dei primer e nell'ottimizzazione dei pannelli.
Specifiche tecniche
Tempo di analisi - 5,5-7,5 ore (solo preparazione delle librerie; non include la quantificazione delle librerie, la normalizzazione o il tempo di pooling)
Specifiche del contenuto - Valutazione dell'RNA dei riarrangiamenti della catena TCRβ, compresi CDR1, CDR2 e CDR3 (con ampliconi di lunghezza fino a 400 bp)
Tempo di utilizzo - < 1,5 ore
Multiplexing - 96 combinazioni a doppio indice
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