Un nuovo frammento di anticorpo che lega le proteine di fusione GFP
Analizzare le proteine di fusione GFP - in una provetta
Le proteine di fusione fluorescenti sono strumenti popolari per studiare la localizzazione delle proteine e la dinamica cellulare. Questi costrutti di solito fondono l'intera proteina bersaglio, o almeno un suo dominio funzionale, con uno dei tanti tipi di proteine fluorescenti reporter. Quelle originariamente derivate dalla medusa A. victoria sono chiamate proteine fluorescenti verdi, o GFP. È facile immaginare le cellule utilizzando un costrutto di proteina di fusione GFP, ma per ottenere un quadro completo i dati di imaging sono spesso combinati con informazioni biochimiche aggiuntive per la proteina (o il dominio proteico) di interesse. Per questi esperimenti biochimici, di solito viene progettata una seconda proteina di fusione che utilizza un dominio "tag" diverso che consente la purificazione. Queste analisi aggiuntive in vitro possono essere utilizzate per confermare la funzionalità del costrutto di fusione "taggato" e per individuare i complessi multiproteici che possono formarsi nell'ambiente cellulare. La mancanza di reagenti specifici, affidabili ed efficienti ha limitato l'uso della GFP e delle relative proteine di fusione fluorescenti, sia per gli studi di biologia cellulare che per le analisi biochimiche dirette.
Le trappole GFP utilizzano frammenti di anticorpi alpaca ad altissima affinità accoppiati a perle di agarosio o a perle di agarosio magnetiche. Queste "Nanobody-Traps" sono perfette per gli esperimenti di immuno-precipitazione, immuno-purificazione e immuno-pulldown con una purezza (e una resa) fino a 10 volte superiore a quella degli anticorpi monoclonali di topo convenzionali. Compatibili con una varietà di materiali di partenza, le Nanobody-Traps possono essere utilizzate con cellule di mammifero, tessuti e organi, batteri, lievito e persino piante.
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