La mappatura ottica del genoma (OGM) richiede DNA ad altissimo peso molecolare (UHMW) etichettato per l'identificazione delle varianti strutturali. Bionano offre una serie di kit di preparazione del campione di DNA per un isolamento semplice e robusto del DNA UHMW da una serie di tipi di campioni importanti. Una volta isolato il DNA, i nostri kit Direct Label and Stain (DLS) possono essere utilizzati per etichettare il DNA da utilizzare con il sistema Saphyr.
Ottenere un isolamento e un'etichettatura robusti del DNA UHMW.
La capacità di visualizzare ampie varianti strutturali genomiche richiede frammenti di DNA intatti di dimensioni eccezionali. La tecnologia Bionano in fase di soluzione (SP) consente l'isolamento di frammenti di DNA che possono raggiungere una lunghezza di >1 Mbp e produce abitualmente frammenti medi di >230 kbp.
In prospettiva, il sequenziamento a lettura breve produce letture fino a 150 bp, mentre il sequenziamento a lettura lunga di alta precisione fornisce letture di lunghezza fino a 25kb.
Isolare il DNA da una serie di tipi di campioni importanti.
I più recenti kit di preparazione del DNA Bionano SP sono in grado di purificare il DNA UHMW da tessuti e tumori, aspirato di midollo osseo (BMA), sangue e cellule, nonché tessuti vegetali e animali. Questa varietà di campioni rende l'OGM adatto all'uso in un'ampia gamma di studi e applicazioni in oncologia, malattie genetiche costituzionali, bioprocessi e ricerca generale.
I kit SP di Bionano richiedono 1,5 * 10^6 cellule (sangue, linee cellulari e BMA) o 10-30 mg di tessuto come input. Il DNA UHMW viene isolato in circa quattro ore utilizzando un processo di lisi, legame e lavaggio e nuovi dischi paramagnetici.
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