Il Bisulfite Sequencing Library Prep Kit (piattaforma illumina) è stato sviluppato per la costruzione di librerie NGS utilizzando come input DNA trattato con bisolfito (50 ng - 500 ng). La metilazione del DNA è un meccanismo epigenetico noto per svolgere un ruolo critico nella regolazione genica e nell'imprinting genomico, bloccando l'accesso dei fattori di trascrizione ai promotori e agli enhancer. Il sequenziamento con bisolfito è una tecnica popolare nella ricerca biomedica, basata sulla conversione da C a T sotto il trattamento del bisolfito di sodio.
Recentemente, la NGS è diventata un potente strumento per identificare lo stato di metilazione del DNA a livello dell'intero genoma con una risoluzione di una singola base. Tuttavia, è noto che il trattamento con bisolfito delle librerie NGS provoca danni enormi alle librerie.
Nel caso della normale preparazione delle librerie di seq al bisolfito (preparazione delle librerie prima della conversione al bisolfito), sono necessarie apparecchiature di taglio del DNA e costosi adattatori metilati. Inoltre, la successiva conversione in bisolfito causa un enorme danno al DNA delle librerie costruite.
BioDynami ha sviluppato una tecnologia unica di preparazione delle librerie per risolvere questi problemi. Questa tecnologia utilizza come input DNA trattato con bisolfito per evitare la significativa perdita di librerie causata dalla conversione in bisolfito. Inoltre, il nostro kit non richiede la fase di taglio del DNA e costosi adattatori metilati. La DNA polimerasi del kit ha una capacità di amplificazione ad alta fedeltà e una tolleranza all'uracile ideale per l'amplificazione di librerie di sequenziamento con bisolfito. La libreria finale è specifica per ogni filamento.
Vantaggi del kit
Protocollo facile e veloce
Facile: tempo di utilizzo solo 10 minuti
Rapido: tempo totale del protocollo circa 1,5 ore
Flusso di lavoro semplice: Meno passaggi
Libreria direzionale
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