Il kit NGS FFPE DNA Library Prep (piattaforme illumina e MGI) è stato sviluppato per la costruzione di librerie di DNA FFPE di alta qualità utilizzando da 10 ng a 400 ng di DNA in ingresso isolato da campioni FFPE (formalin-fixed, paraffin-embedded). Il danno al DNA causato dalla fissazione rende difficile la costruzione di librerie di alta qualità. Il nostro kit è stato ottimizzato per riparare il DNA danneggiato nelle reazioni. È possibile il multiplexing della libreria di DNA NGS FFPE.
I campioni FFPE sono una grande risorsa per la ricerca biomedica. Tuttavia, i metodi di fissazione e le condizioni di conservazione danneggiano significativamente il DNA dei campioni. Pertanto, l'estrazione di DNA di alta qualità da campioni FFPE rappresenta spesso una sfida. La bassa resa e la bassa qualità del DNA FFPE sono generalmente comuni a causa del materiale tissutale limitato e della degradazione del DNA.
Di conseguenza, è solitamente difficile costruire librerie NGS di alta qualità a partire da una bassa quantità e qualità di DNA FFPE. Per risolvere questo problema, abbiamo sviluppato il kit di preparazione delle librerie di DNA FFPE NGS per ottenere librerie di alta qualità da campioni di DNA FFPE a basso input.
Per il kit NGS FFPE DNA Library Prep della piattaforma illumina sono disponibili tre tipi di indici:
Non indice: le librerie non hanno indice.
Indice: ciascuno dei nostri primer indice contiene un DNA codice a barre unico (lungo 6 basi) che può essere utilizzato per identificare la singola libreria. Il multiplexing delle librerie è fino a 48 campioni. Le informazioni sull'indice possono essere scaricate qui.
Doppio indice unico: Il multiplexing di librerie di DNA FFPE è possibile con 96 campioni grazie al sistema unico di doppio indice.
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