Modulo software da ricerca SimpleSlideInterface

per laboratorio di istopatologiaper microscopia virtualed'imaging macroscopico di patologia

Panoramica
SimpleSlideInterface è un'API di tipo REST e un'interfaccia software che fornisce accesso programmabile e strutturato a vetrini di patologia digitale, annotazioni e metadati. Integra le soluzioni 3DHISTECH (SlideCenter, SlideStorageDX) e i repository locali con sistemi di terze parti per abilitare analisi d'immagine automatizzate, flussi di lavoro IA, ricerca ad alto rendimento e collaborazione clinica multiutente.

Capacità

• Accesso efficiente ai vetrini: recupero, apertura e interrogazione di vetrini da storage locale, SlideCenter e SlideStorageDX.
• Recupero dei metadati: estrazione di proprietà quali dimensioni, risoluzione, canali e mappe di scansione.
• Gestione avanzata di tile e immagini: lettura di tile o regioni specifiche in base a coordinate, ingrandimento e indici di fuoco.
• Gestione delle annotazioni: lettura/inserimento/cancellazione di annotazioni in GeoJSON; supporto per marcatori TMA.
• Accesso al campo visivo originale (FOV): recupero dei dati grezzi della camera (licenza richiesta).
• Ricerca e filtraggio: ricerche di cartelle e vetrini in repository locali e remoti.
• Supporto per sviluppatori: API di tipo REST con esempi Python e integrazione Jupyter Notebook per prototipazione rapida.

Caratteristiche chiave (alto livello)

• API di tipo REST per accesso e manipolazione dei vetrini.
• Esempi Python e supporto Jupyter Notebook.
• Recupero efficiente dei tile e lettura selettiva delle regioni.
• Opzioni di integrazione sicure per deploy di ricerca e clinici.

Varianti di prodotto e licenze

• SimpleSlideInterface (Research Version): edizione orientata alla ricerca con accesso gratuito alle funzionalità principali; throughput locale limitato e upgrade a pagamento per accesso locale illimitato e recupero tile più veloce.
• SimpleSlideInterface DX (Integration Version): edizione di integrazione per sistemi clinici/diagnostici con accesso completo a SlideStorageDX mediante licenza e accesso sicuro alle immagini senza recupero dei dati dei pazienti.
• Limitazioni della versione gratuita: singola istanza, accesso locale limitato, recupero tile limitato a 1000 tile/s (64 MP/s).

Funzionalità aggiuntive

• Cache per vetrino dei dati immagine e attributi all'apertura.
• Supporto lettura/scrittura annotazioni GeoJSON e gestione marcatori TMA.

Requisiti di sistema

• Hardware: CPU 4 core con AVX2 (Intel Haswell o AMD Zen), 4 GB di RAM, 1,0 GB di spazio libero su disco.
• SO: Windows 10 Pro (64-bit) o Windows Server 2019 (64-bit) minimo.
• Rete: larghezza di banda minima 1 Gb/s; 10 Gb/s raccomandato per archivi di vetrini remoti.
• Prestazioni: supporta ~8 vetrini per thread CPU; ~100 MB di RAM per vetrino aperto.
• Software: Microsoft .NET 8.0 (per hosting Windows Server); Visual C++ 2015-2022 Redistributable (x64).

Note
È necessaria un'ampia larghezza di banda di rete quando si integra con SlideCenter/SlideStorageDX o si ospita su una macchina remota. L'interfaccia effettua caching dei dati immagine e degli attributi all'apertura di un vetrino, influenzando l'utilizzo della memoria.

Specifiche tecniche

• Tipo di interfaccia: API di tipo REST
• Integrazioni principali: SlideCenter, SlideStorageDX, repository locali di vetrini
• Supporto sviluppatori: esempi Python, esempi Jupyter Notebook
• Formato annotazioni: GeoJSON (lettura/inserimento/cancellazione)
• Limite recupero tile (gratuito): 1000 tile/s (64 Megapixel/s)
• Recupero FOV camera originale: disponibile (licenza richiesta)
• Uso memoria per vetrino: ~100 MB all'apertura
• Requisiti CPU: 4 core con AVX2; supporta 8 vetrini per thread CPU
• RAM minima: 4 GB
• Disco minimo: 1,0 GB libero
• Larghezza di banda rete minima: 1 Gb/s (10 Gb/s raccomandato)
• Runtime richiesto: Microsoft .NET 8.0 (per hosting Windows Server)