Ottimizzato per l'ingresso di piccoli frammenti: Ideale per frammenti di DNA piccoli e danneggiati, come il DNA privo di cellule (cfDNA).
Richiamo accurato della metilazione: Il protocollo basato sulla ligazione diretta consente letture accurate e la chiamata di metilazione dei termini nativi per ogni frammento di DNA.
Flusso di lavoro semplice e snello: Preparazione di robuste librerie methyl-seq in soli 3 passaggi.
DESCRIZIONE
Il kit di librerie Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS offre un flusso di lavoro ottimizzato e affidabile per la preparazione di librerie WGBS (whole genome bisulfite sequencing) da DNA privo di cellule (cfDNA). Questo kit all-inclusive presenta una procedura semplice in grado di preparare librerie methyl-seq di alta qualità da appena 5 ng di cfDNA. Il processo viene completato in tre fasi fondamentali: conversione del bisolfito, legatura diretta dell'adattatore e amplificazione PCR dell'indice.
Il trattamento iniziale con bisolfito è delicato sul cfDNA ma efficace nel convertire le citosine non modificate in uracile. Successivamente, gli innovativi adattatori splintati catturano e legano direttamente gli adattatori compatibili con Illumina su frammenti di DNA di qualsiasi dimensione, consentendo il sequenziamento di frammenti di DNA intaccati, danneggiati e corti che altrimenti sarebbero stati scartati con i metodi tradizionali di preparazione delle librerie. La legatura diretta degli adattatori elimina inoltre la necessità di effettuare la sintesi del secondo filamento, la riparazione dell'estremità e le fasi di codifica dA, riducendo così i bias e preservando l'integrità di qualsiasi metilazione nativa presente sui terminali del frammento. Infine, il cfDNA legato agli adattatori viene indicizzato e amplificato tramite PCR con gli UDI Zymo-Seq, generando librerie pronte per il sequenziamento su qualsiasi strumento Illumina.
Sequenze di codici a barre - Consultare la sezione Documenti.
---