Il pannello NEX-t v1.0 si rivolge a una serie di sequenze caratteristiche selezionate dai genomi di centinaia di agenti patogeni, tra cui virus, batteri, funghi e parassiti. Copre una vasta gamma di contenuti, tra cui 16S/ITS, geni housekeeping, geni correlati alla resistenza ai farmaci e altro ancora.
Prestazioni
Design innovativo e unico
Il pannello NEX-t v1.0 è costituito principalmente dai seguenti tre componenti:
(1) sonde progettate per le sequenze caratteristiche di centinaia di specie, tra cui virus, batteri, funghi e parassiti, come elencato nella Tabella 1.
confronto di più sequenze di riferimento all'interno di specie o generi, selezionando le regioni all'interno dell'intervallo di tolleranza della sonda e contenenti un certo grado di diversità.
incorporazione di sequenze coinvolte nella tipizzazione multi-locus (MLST).
integrazione della letteratura pertinente.
(2) Un piccolo set di sonde universali progettate per 16S/ITS.
riferimento da più banche dati (SILVA,Greengenes,RDP,Unite)
(3) Sonde progettate per la resistenza ai farmaci, la virulenza e i geni correlati.
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