Una delle considerazioni più importanti prima di eseguire l'elettroforesi su gel 2D è la scelta dei tamponi di solubilizzazione delle proteine. Un tampone adatto deve solubilizzare le proteine in modo efficace, senza disturbare la carica nativa delle proteine.
L'urea, un comune caotropio, è ampiamente utilizzata per la solubilizzazione e la denaturazione delle proteine. Uno degli svantaggi dell'uso dell'urea è la carbamilazione. In acqua, l'urea esiste in equilibrio con il cianato di ammonio, il cui livello aumenta con l'aumentare della temperatura e del pH. Il cianato reagisce con i gruppi α-ammino ed ε-ammino delle proteine e induce una variazione del punto isoelettrico delle proteine. Questo porta a risultati artefatti. Pertanto, la carbamilazione deve essere evitata
Un modo per ridurre al minimo il rischio di carbamilazione è quello di preparare i reagenti a base di urea freschi prima di ogni utilizzo. G-Biosciences ha sviluppato una serie di tamponi di solubilizzazione secchi, a base di urea, premiscelati e pronti all'uso. È sufficiente aggiungere al tampone secco un volume appropriato del tampone di reidratazione fornito. Quindi utilizzare per solubilizzare le proteine, risparmiando tempo e migliorando la qualità dell'elettroforesi su gel IEF/2D (in attesa di brevetto).
I tamponi di estrazione FOCUS™ sono progettati anche per essere utilizzati come tamponi di reidratazione per le strisce IPG
I tamponi di estrazione FOCUS™ sono costituiti da concentrazioni ottimizzate sperimentalmente di agenti critici, tamponanti e stabilizzanti, tra cui urea, tiourea, Nonidet® P-40, CHAPS e sulfobetaine. I tamponi di estrazione FOCUS™ sono progettati per produrre un'estrazione ottimale delle proteine e una migliore risoluzione degli spot per l'analisi su gel 2D.
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