Le "bolle" standard sono miscele equimolari di due o più basi diverse in una determinata posizione all'interno di un oligonucleotide. Gli oligo con wobbles possono essere utilizzati come sonde da ibridare con un gene sconosciuto che codifica una sequenza proteica nota, per la mutagenesi casuale e per la chimica combinatoria.
Per l'introduzione di wobbles nelle sequenze di oligo, fare sempre riferimento ai codici di base dell'Unione Internazionale di Biochimica (IUB).
Le basi miste (note anche come basi degenerate o wobble) seguono i codici IUB:
D=A/G/T
M=A/C
H=A/C/T
W=A/T
R=A/G
Y=C/T
V=A/C/G
S=C/G
K=G/T
N=A/G/C/T
B=C/G/T
Gli oligonucleotidi prodotti con basi miste danno luogo a un prodotto finale che è una popolazione eterogenea di specie distinte. MW, Tm e coefficiente di estinzione possono essere fortemente influenzati dall'aggiunta di basi miste. Invece di riportare i vari valori per ciascun componente, viene fornito un unico valore.
Specifiche
Modifica
Posizione di modifica
3'
Conservazione e stabilità
Condizione di risospensione
- Far girare brevemente la provetta per raccogliere il pellet sul fondo della provetta - Aggiungere un volume appropriato di tampone raccomandato (fare riferimento alla scheda tecnica) - Lasciare riposare la provetta per alcuni minuti - Vortexare la provetta per 15 secondi
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