Software medico Nexus Copy Number™

di analisidi visualizzazioneNGS

Il software Nexus Copy Number consente ai ricercatori di analizzare più tipi di dati - array, pannelli NGS, WES/WGS e dati di espressione - attraverso coorti di ricerca per una visione a livello di genoma. Rivela nuove intuizioni con incredibile semplicità grazie a una serie di strumenti avanzati di analisi e visualizzazione. Integrare i dati fenotipici e genomici per scoprire correlazioni genetiche significative. Associare un numero illimitato di annotazioni o attributi dei campioni per ulteriori analisi a valle. Utilizzate lo strumento di potere predittivo per trovare correlazioni tra attributi fenotipici e cambiamenti genomici, eseguire analisi di sopravvivenza per i campioni di cancro (con diagrammi di Kaplan-Meir) o stratificare i campioni in base ai profili di aberrazione e ai fenotipi per identificare le mutazioni driver. Nexus Copy Number consente il raggruppamento mediante K-means o clustering gerarchico con la possibilità di regolare il numero di cluster. Identificare i termini dell'ontologia genica (GO) arricchiti sull'intero genoma utilizzando GSEA o trovare termini GO significativamente sovrarappresentati solo in regioni selezionate. Utilizzare la funzione di concordanza per identificare le alterazioni genomiche co-occorrenti con cambiamenti del numero di copie, regioni LOH o piccole mutazioni e rappresentare queste relazioni in un grafico circolare. Analizzate e visualizzate più campioni in parallelo, senza bisogno di competenze bioinformatiche. Nexus Copy Number offre robuste funzioni statistiche e una ricca grafica interattiva, senza bisogno di competenze di programmazione grafica e statistica. Si tratta di una potente soluzione desktop (Windows o Mac OS) che consente la visualizzazione e l'analisi di decine di migliaia di array ad alta densità in parallelo.