Il Multiplexing Unique Dual Index Primers contiene una miscela di primer per il multiplexing di campioni per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) sulla piattaforma illumina. Il multiplexing dei campioni NGS riduce i costi di sequenziamento raggruppando più librerie NGS in un'unica corsia della cella a flusso.
Abbiamo sviluppato un sistema di indicizzazione della differenza di quattro basi. Il sistema ci permette di creare indici che hanno almeno 4 basi diverse l'uno dall'altro nella lunghezza dell'indice di 8 basi. I nostri esclusivi primer a doppia indicizzazione eliminano gli errori di sequenziamento come il salto di indice, la contaminazione incrociata di indice, l'assegnazione errata delle letture, gli errori di amplificazione e gli errori di de-multiplexing.
Caratteristiche
Migliora la specificità dell'identificazione del campione con il sistema di indicizzazione a 4 basi di differenza
Ogni indice ha almeno 4 basi diverse dagli altri indici
la differenza di 4 basi aumenta notevolmente la specificità rispetto alla differenza di 3 basi degli altri fornitori.
Aumenta la capacità di multiplazione
96 coppie uniche premiscelate di primer indice i5 e i7
Riduce al minimo gli errori di sequenziamento quali:
Salto di indice
Contaminazione incrociata degli indici
Errata assegnazione delle letture
Errori di amplificazione
Errori di de-multiplexing
Identificazione dell'index hopping mediante unique dual index. sono state realizzate 96 librerie utilizzando il BioDynami NGS DNA Library Prep Kit e i BioDynami Multiplexing Unique Dual Index Primers. Le librerie sono state raggruppate a pari concentrazione e sequenziate su illumina HiSeq 4000. Il numero di letture di tutte le librerie è stato demultiplexato e analizzato.
Demultiplexed: corretta combinazione di indici i5 e i7
Salto di indice identificato: codici a barre corretti, ma combinazione di indici i5 e i7 NON corretta
Altro: non rientra nelle categorie precedenti
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