Software per genomica Nexus Copy Number

da ricercada laboratoriodi analisi di dati

Strumenti statistici facili da usare e potenti Armare i ricercatori con strumenti avanzati di analisi e visualizzazione dei dati genomici. Un software facile da usare fornisce strumenti statistici all'avanguardia per far progredire la scoperta scientifica. Caratteristiche e vantaggi Identificazione degli eventi di cooperazione, analisi di arricchimento e clustering Confronti tra profili genomici per identificare differenze statisticamente significative Analisi e visualizzazione di più campioni in parallelo - non è richiesta alcuna competenza bioinformatica Integrazione di mRNA, miRNA, varianti di sequenza, metilazione e modifica del numero di copie per identificare gli hotspot genomici Richiesta di informazioni per regione/gene su più progetti da GEO e TCGA tramite il repository Nexus DB Integrare dati fenotipici e genomici per scoprire correlazioni significative 1. Numero di copia da NGS & Microarray Alimentato con l'algoritmo di chiamata CNV standard in oro, il software Nexus Copy Number deriva il numero di copia e il BAF da una varietà di dati NGS (WES, WGS, pannello mirato e sequenziamento poco profondo) così come i dati Microarray. 2. Supporto per tutti i principali fornitori di strumenti sia per NGS che per Microarray Nexus Copy Number è un software desktop multiforme per la scoperta rapida di alterazioni genomiche. Questo software-agnostico di piattaforma accetta dati di vari produttori e tecnologie, comprese le più recenti piattaforme: Infinium GSA e CytoScan XON. 3. Potenti strumenti di ricerca e statistici La visualizzazione interattiva e i potenti strumenti statistici consentono di rilevare le variazioni strutturali (ad es. numero di copie, regioni omozigoti), l'associazione con le variazioni di sequenza (mutazioni puntiformi, InDel, inversioni, ecc.),