Gli isolatori sterili sono utilizzati per produrre sostanze come le infusioni miste (vitamine, oligoelementi, grassi) che vengono utilizzate per nutrire i neonati o i pazienti con un tratto digestivo compromesso. Gli isolatori utilizzati per questo tipo di applicazione sono anche chiamati isolatori TPN (Total Parenteral Nutrition). Altre applicazioni degli isolatori sterili comprendono l'ingegneria dei tessuti e il trattamento delle cellule viventi. Poiché in questo caso vengono trattati esclusivamente materiali non tossici, l'isolatore funziona in condizioni di sovrapressione. Di conseguenza, gli isolatori sterili sono progettati innanzitutto per garantire la protezione del prodotto.
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