Veloce: tempo di lavoro 8 volte inferiore rispetto ai protocolli convenzionali di preparazione delle librerie 16S.
Facile: la piastra premiscelata riduce al minimo il tempo di lavoro e gli errori di manipolazione.
Flusso di lavoro semplice: 100% pronto per l'automazione con un solo passaggio di PCR e senza necessità di normalizzazione. È sufficiente raggruppare i campioni a parità di volume!
DESCRIZIONE
Il kit Quick-16S Plus NGS Library Prep (V4) è il più semplice e veloce kit di preparazione di librerie NGS per la regione V4 del gene 16S rRNA per il sequenziamento ad alto rendimento. Il protocollo, facile da automatizzare, utilizza una piastra di amplificazione premiscelata e una singola qPCR/PCR per l'amplificazione mirata e l'aggiunta del codice a barre. Il raggruppamento in volumi uguali e una singola pulizia della libreria finale, anziché una pulizia massiccia basata sulle microsfere AMPure® , semplificano il processo di preparazione della libreria. Non sono necessarie ulteriori analisi di quantificazione delle librerie, come l'analisi TapeStation® o l'elettroforesi su gel. Grazie a queste caratteristiche, il flusso di lavoro riduce drasticamente il tempo di preparazione delle librerie a soli 30 minuti.
Dimensione dell'amplicone - La dimensione finale dell'amplicone dopo la PCR 1-Step (amplificazione mirata e aggiunta del codice a barre) è di ~388 bp.
Apparecchiature necessarie (fornite dall'utente) - Microcentrifuga, centrifuga per piastre, sistema di PCR quantitativa in tempo reale a 96 pozzetti (si raccomanda la compatibilità con SYBR Green) o sistema di PCR standard e piastre per PCR in tempo reale a 96 pozzetti.
Sequenze indice - Gli indici da 10 bp sono elencati nel modello di foglio campioni MiSeq fornito.
Input del campione - DNA microbico purificato (≤100 ng), privo di inibitori della PCR.
Piattaforma di sequenziamento - Compatibile con tutte le piattaforme di sequenziamento Illumina® utilizzando primer di sequenziamento personalizzati. Si consiglia il MiSeq® Reagent Kit v2 (300 cicli).
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