Il kit Hieff NGSTM MaxUp Human rRNA Depletion (rRNA & ITS/ETS) è stato progettato per rimuovere l'rRNA e 45S ITS/ETS dall'RNA totale umano, di topo e di ratto in base a un flusso di lavoro basato sulla RNasi H e per conservare l'mRNA e altri RNA non codificanti. Questo kit è adatto sia per campioni di RNA intatti che parzialmente degradati (ad esempio, RNA FFPE). Poiché i campioni FFPE degradati contengono solitamente una percentuale più elevata di ITS/ETS rispetto ai campioni di tessuto fresco, questo kit aggiunge sonde nella regione 45S ITS/ETS umana e la rimozione dell'ITS può aumentare significativamente la percentuale di dati validi nei dati grezzi.
Caratteristiche
Forte specificità: rimuove in modo specifico l'rRNA e l'ITS/ETS dai campioni umani, soprattutto per i campioni FFPE
Elevata compatibilità della quantità di template di partenza: applicabile a 100 ng~1μg di campione
Elevato effetto di rimozione: per rRNA, ITS ed ETS in campioni di topo e ratto umani, l'effetto di rimozione è superiore al 95%
Qualità stabile: rigoroso controllo di qualità delle prestazioni e della stabilità dei lotti
Applicazioni
Ricerca sull'espressione genica
Analisi dello splicing alternativo
Individuazione e scoperta di RNA non codificante
individuazione di siti di poliadenilazione selettivi
Rilevamento di geni di fusione
Specifiche
Tecnologia di deplezione - RNasi H
Tipo di campione - RNA totale di uomo, topo e ratto
Tipo di prodotto finale - mRNA e altri RNA non codificanti
Numero di reazioni - 24/96 Preparazioni
Quantità di materiale di partenza - 100 ng~1 μg di RNA totale
Obiettivo - Rimuovere rRNA e 45S ITS/ETS dall'RNA totale umano
Figure
specificità di rimozione dell'rRNA
Per i campioni convenzionali, l'rRNA e l'ITS/EST possono essere rimossi per oltre il 98%, mentre per i campioni FFPE con integrità di circa il 50%, l'rRNA e l'ITS/EST possono essere rimossi per oltre il 95%. Allo stesso tempo, è possibile rimuovere efficacemente anche FFPE con scarsa integrità.
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