Software medico LD1

per LAMPdi progettazionedi condivisione

Evitare l'omologia automatica e la struttura a template Opzioni BLAST locale e desktop Recupero automatico delle sequenze Visualizzazione delle sequenze Calcolatore di primer Gestione dati e database Generare rapporti Informazioni su LAMP Designer OptiGene offre un'applicazione software utilizzata per progettare primer efficienti per i saggi di amplificazione isotermica mediata da loop o LAMP. LAMP è un metodo di amplificazione isotermica del DNA inventato dalla Eiken Chemical Company Ltd del Giappone e può essere utilizzato per amplificare poche copie di DNA fino a 109 copie in soli 30 minuti. Il metodo LAMP accoppiato alla trascrizione inversa può essere applicato anche per l'amplificazione di sequenze di RNA. LAMP impiega sei primer appositamente progettati che riconoscono otto regioni distinte nel DNA bersaglio e la progettazione di questi sei primer è fondamentale per il successo del test. LAMP Designer recupera direttamente nel programma lotti di sequenze geniche da fonti on-line come GenBank. L'applicazione può eseguire una ricerca BLAST per evitare omologie incrociate durante la progettazione dei primer. Supporta inoltre le opzioni Local e Desktop BLAST per l'utilizzo di database personalizzati e non pubblicati. LAMP Designer incorpora una vista della sequenza con i primer marcati sulla sequenza e calcola la temperatura di fusione, Tm, utilizzando la teoria termodinamica del nearest neighbour e valori SantaLucia altamente accurati. Il software esporta anche un rapporto di qualità di pubblicazione per i saggi progettati, da condividere con i colleghi. I dati sono organizzati in formato di progetto e viene mantenuto un database locale di informazioni sulla sequenza e sui risultati della ricerca. Evitare le omologie incrociate LAMP Designer interpreta automaticamente i risultati della ricerca BLAST