Poiché le nuove tecnologie di colorazione, come la citometria di massa per immagini (IMC™, Standard BioTools) e i pannelli fluorescenti high-plex (Akoya PhenoCycler®), ampliano le nostre capacità di interrogare il microambiente tumorale utilizzando la biologia spaziale, trovare differenze significative nei dati diventa una sfida.
Il nostro flusso di lavoro end-to-end per tutte le esigenze di analisi di immagini multiplex contiene tutte le fasi in un unico software:
Visualizzare
Importazione di immagini da tutti i principali formati di immagini multiplex (Akoya Biosciences, Standard BioTools, Lunaphore, Rarecyte, Ionpath, Canopy Biosciences, Olympus, Zeiss e altri). Impostare gruppi di canali di colore definiti dall'utente per combinazioni di biomarcatori e passare facilmente da un canale all'altro per una rapida visualizzazione di tipi di cellule/gruppi di marcatori e per il controllo qualità iniziale delle immagini. Assegnate i colori a singoli canali o gruppi di canali e rivedete ogni canale per assicurarvi che contenga dati validi. Escludere singoli canali dalle analisi a valle durante una fase di QC.
Classificazione dei tessuti
Utilizzate la segmentazione dei tessuti basata su Paint-to-Train AI su qualsiasi combinazione di marcatori per individuare le regioni morfologiche del campione: tumore, stroma, necrosi, artefatti, ecc. Utilizzare queste regioni per informare meglio la localizzazione delle popolazioni immunitarie e di altre cellule in relazione al tumore, allo stroma, ecc. Suddividere ulteriormente il tumore in sottoregioni, escludere automaticamente le aree non rilevanti (vetrino vuoto, artefatti, ecc.) e creare margini intorno a specifiche regioni di interesse, ad esempio per definire un fronte tumorale invasivo.
Rilevamento delle cellule
Utilizzate i nostri algoritmi preaddestrati di rilevamento nucleare e segmentazione cellulare basati sull'apprendimento profondo per la citometria di massa a fluorescenza (DAPI) e a immagini (canali DNA-Iridio). Se avete requisiti speciali per il rilevamento delle cellule,
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