Histopathology Atlas fornisce uno strumento applicativo per l'immagine e i filmati, che potrebbe caricare l'immagine per il funzionamento. I formati di lettura delle immagini supportano i file *.jpg, *.png, *.tif, *.bmp e altri formati immagine. I formati di lettura dei filmati supportano i file *.mkv, *.mp4, *.avi, *.mov e altri file in formato filmato. L'interfaccia operativa del sistema Histopathology Atlas include la selezione dell'uso delle interfacce dei menu Pathology e Histology. L'interfaccia operativa principale dell'immagine è l'interfaccia di visualizzazione dell'immagine in 2D e fornisce la selezione e l'uso degli strumenti, compresi l'elenco delle immagini, gli strumenti di base, gli strumenti di pennello, gli strumenti di regolazione delle immagini e le funzioni di memorizzazione delle note.
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