Il PPSQ è uno strumento per la determinazione delle sequenze aminoacidiche di proteine e peptidi, che combina una sezione di reazione di Edman con un cromatografo liquido ad alte prestazioni (HPLC). Ne esistono due tipi: il PPSQ-51A, dotato di un reattore, e il PPSQ-53A, dotato di tre reattori. Sul PPSQ-53A è possibile eseguire l'analisi continua delle sequenze di amminoacidi di più campioni, uno dopo l'altro. Nella sezione di reazione Edman, gli amminoacidi vengono scissi in ordine dall'N-terminale di una proteina eseguendo ripetutamente la degradazione Edman e vengono derivatizzati. Di conseguenza, vengono prodotti amminoacidi PTH stabili. I PTH-amminoacidi vengono iniettati online nell'HPLC e vengono analizzati. I dati HPLC vengono salvati sul PC e il software di elaborazione dei dati viene utilizzato per elaborare i cromatogrammi. Successivamente, viene utilizzato un software per la stima della sequenza degli aminoacidi per identificare gli aminoacidi e stimare le sequenze.
Vantaggi dell'utilizzo della degradazione di Edman per il sequenziamento degli aminoacidi
(1) Garanzia della sequenza N-terminale delle proteine
(2) Non è necessario alcun pretrattamento del campione
(3) Differenziazione di aminoacidi isobarici (leucina e isoleucina)
(4) Identificazione possibile anche da proteine sconosciute non registrate in database
Caratteristiche
1. Sicurezza
Gli utenti sono gestiti in base a gruppi, e ogni utente è riconosciuto tramite un nome utente e una password. È possibile creare gruppi unici includendo persone con diversi privilegi di accesso. La chiara definizione dei privilegi di accesso di ciascun utente impedisce modifiche non autorizzate alle impostazioni, al funzionamento dello strumento e all'accesso ai dati
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